246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3335 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  357  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  67.8 
 
 		 178 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  65.54 
 
 		 177 aa  246  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  64.41 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  58.19 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  55.37 
 
 		 181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.24 
 
 		 176 aa  209  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.89 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  44.32 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  45.98 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  45.57 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.34 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  44.94 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  43.27 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  41.52 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  41.42 
 
 		 390 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  40.94 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.11 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  38.01 
 
 		 199 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  38.6 
 
 		 207 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.08 
 
 		 212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  34.86 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.43 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  38.2 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  36.09 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.29 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.82 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  39.31 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  34.09 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.9 
 
 		 188 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  38.82 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  39.86 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.95 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  57.33 
 
 		 75 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  32.75 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.18 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  38.85 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  36.31 
 
 		 210 aa  92  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  38.78 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.4 
 
 		 184 aa  87.8  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  36.13 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  36.08 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  30.41 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  31.51 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  30.82 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  35.17 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.76 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  30.82 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  30.82 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.97 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  32.97 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.81 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  30.82 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.48 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  30.82 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  30.82 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  30.14 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  30.14 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.07 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  31.69 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.05 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.86 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.64 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  30.52 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.85 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.76 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  28.65 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.66 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.3 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.21 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.03 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  29.56 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  32.58 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  28.35 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.69 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  29.53 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  23.49 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.1 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1685  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.37 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>