More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3276 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  100 
 
 		 381 aa  772    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  87.5 
 
 		 368 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  71.13 
 
 		 391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  66.49 
 
 		 368 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  68.03 
 
 		 368 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  67.66 
 
 		 368 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  49.86 
 
 		 372 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  44.66 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  46.58 
 
 		 377 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  44.2 
 
 		 375 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  41.98 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  45.03 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  43.75 
 
 		 370 aa  288  8e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  46.33 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  42.86 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  45.45 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  42.97 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  42.16 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  44.35 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  45.73 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  45.73 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  45.73 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  45.73 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  45.73 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  45.73 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  45.73 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  46.01 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  45.45 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  45.45 
 
 		 372 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  45.45 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  39.94 
 
 		 376 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  40 
 
 		 374 aa  255  9e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  41.37 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  39.89 
 
 		 375 aa  249  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  40.72 
 
 		 370 aa  249  8e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  39.84 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  40.23 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  38.83 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  38.83 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  37.7 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  41.22 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  36.84 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  33.6 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  29.66 
 
 		 402 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  29.27 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  25.8 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  27.36 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  25.67 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  27.61 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  26.42 
 
 		 427 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  26.94 
 
 		 407 aa  97.1  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  25.12 
 
 		 423 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  27.63 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  27.61 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  27.78 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  23.27 
 
 		 414 aa  92.8  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  25.5 
 
 		 407 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  26.84 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  24.25 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  27.14 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  25.74 
 
 		 422 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  25.43 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  25.82 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  28.99 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  26.84 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  24.94 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  28.17 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5042  peptidase T  24.32 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.918686 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  25.06 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  24.81 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  24.81 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  24.81 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  24.81 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  24.81 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  24.81 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5411  peptidase T  24.02 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.683579  normal  0.180292 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  24.81 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1755  peptidase M20  25.27 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  24.81 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  24.76 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  24.94 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  26.8 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  32.52 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  25.12 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  28.31 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  27.7 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  31.4 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  25.89 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  24.04 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  24.16 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  25.27 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  26.74 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  23.5 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  29.5 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  25.19 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  25.95 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  22.7 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  27.72 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  22.7 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.68 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>