53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3235 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  100 
 
 
627 aa  1199    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  42.9 
 
 
552 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  35.61 
 
 
517 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  32.57 
 
 
483 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  28.74 
 
 
564 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  31.17 
 
 
392 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  29.21 
 
 
500 aa  91.3  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  29.43 
 
 
481 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  31.12 
 
 
498 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  29.88 
 
 
502 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.13 
 
 
453 aa  84  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  27.26 
 
 
481 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  28.61 
 
 
502 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  26.65 
 
 
503 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  34.11 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  27.59 
 
 
502 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  29.84 
 
 
498 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  31.27 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  27.53 
 
 
496 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  27.16 
 
 
496 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  29.15 
 
 
483 aa  65.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  27.16 
 
 
496 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  27.16 
 
 
496 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  30.13 
 
 
451 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  27.73 
 
 
496 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  28.13 
 
 
457 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  34.65 
 
 
156 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  28.89 
 
 
578 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  32.28 
 
 
157 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  36.3 
 
 
183 aa  50.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  32.28 
 
 
157 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  31.16 
 
 
157 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  29.84 
 
 
441 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  27.61 
 
 
482 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1422  cryptic curlin major subunit  35.96 
 
 
152 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  33 
 
 
470 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  28.45 
 
 
444 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  29.53 
 
 
434 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  30.37 
 
 
180 aa  47.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.33 
 
 
170 aa  47.4  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  31.96 
 
 
245 aa  47.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  41.12 
 
 
151 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  33.77 
 
 
178 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  33.33 
 
 
151 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  35.64 
 
 
143 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2089  cryptic curlin major subunit  35.96 
 
 
151 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.226612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  33 
 
 
151 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  33 
 
 
151 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  33 
 
 
151 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  40.37 
 
 
151 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  33 
 
 
139 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  37 
 
 
142 aa  44.3  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  35 
 
 
139 aa  44.3  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>