280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3232 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  73.22 
 
 
478 aa  733    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  72.8 
 
 
478 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  72.29 
 
 
480 aa  732    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  80.75 
 
 
481 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
489 aa  1008    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  76.15 
 
 
490 aa  751    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  73.11 
 
 
478 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  72.08 
 
 
480 aa  729    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  74.17 
 
 
480 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  74.17 
 
 
480 aa  746    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  74.23 
 
 
490 aa  768    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  73.64 
 
 
480 aa  744    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  66.74 
 
 
484 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  72.5 
 
 
480 aa  733    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  50.11 
 
 
462 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  50.11 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  49.58 
 
 
476 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  51.35 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  49.04 
 
 
465 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  49.03 
 
 
464 aa  435  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  50.57 
 
 
462 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.58 
 
 
464 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.66 
 
 
455 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  45.21 
 
 
469 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.67 
 
 
467 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  46.64 
 
 
470 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  45.92 
 
 
468 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.62 
 
 
466 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  44.02 
 
 
467 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.68 
 
 
540 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.62 
 
 
466 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  44.37 
 
 
467 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.21 
 
 
543 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.83 
 
 
536 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.21 
 
 
541 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  42.52 
 
 
531 aa  362  1e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.21 
 
 
474 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  41.08 
 
 
515 aa  359  6e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  44.57 
 
 
467 aa  359  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  39.58 
 
 
570 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 
525 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  41.53 
 
 
522 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.64 
 
 
471 aa  345  8e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  44.9 
 
 
467 aa  345  8e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  42.33 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.34 
 
 
525 aa  342  7e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 
544 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 
524 aa  340  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.7 
 
 
469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.41 
 
 
530 aa  335  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 
464 aa  334  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  40.45 
 
 
547 aa  332  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.27 
 
 
470 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.05 
 
 
465 aa  330  3e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
465 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.7 
 
 
469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 
536 aa  329  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
536 aa  326  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  40.97 
 
 
462 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  40.97 
 
 
462 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 
465 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  38.02 
 
 
535 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 
451 aa  319  7e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  40.14 
 
 
464 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.43 
 
 
536 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  39.55 
 
 
465 aa  316  6e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 
535 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  38.43 
 
 
468 aa  310  5e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.46 
 
 
467 aa  309  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 
464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.78 
 
 
468 aa  306  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  41.74 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  40.95 
 
 
452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  38.14 
 
 
470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  38.7 
 
 
460 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  38.36 
 
 
455 aa  302  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  38.31 
 
 
547 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  38.56 
 
 
470 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.7 
 
 
460 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 
454 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  38.48 
 
 
460 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 
454 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 
461 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
447 aa  295  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  39.01 
 
 
453 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  37.25 
 
 
466 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 
452 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
468 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  38.6 
 
 
455 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 
452 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.37 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
542 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  39.4 
 
 
485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 
457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  36.81 
 
 
452 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  37.19 
 
 
452 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 
455 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  38.53 
 
 
452 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>