47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3183 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  100 
 
 		 382 aa  754    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  79.06 
 
 		 425 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  77.72 
 
 		 424 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  75.65 
 
 		 421 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  77.51 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  77.51 
 
 		 424 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  76.44 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  76.82 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  78.04 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  77.25 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  77.25 
 
 		 424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  76.3 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  74.34 
 
 		 422 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  48.82 
 
 		 421 aa  348  9e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  48.82 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  46.6 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  50 
 
 		 421 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  44.76 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  43.57 
 
 		 419 aa  288  8e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  41.88 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  41.88 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  46.35 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  40.21 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  40.58 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  41.47 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  34.92 
 
 		 437 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  34.92 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  33.59 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  36.68 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  36.23 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  34.51 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  36.43 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  36.43 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  36.96 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  35.44 
 
 		 427 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  34.7 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  34.91 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  36.34 
 
 		 431 aa  196  7e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  36.79 
 
 		 460 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  87.1 
 
 		 48 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.65 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  23.33 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  22.94 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  24.58 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  31.62 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  21.48 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  23.98 
 
 		 453 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>