289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3148 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
156 aa  322  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.32782e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  88.46 
 
 
156 aa  293  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.16859e-08  decreased coverage  2.22893e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  87.18 
 
 
156 aa  291  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.1317e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  87.82 
 
 
156 aa  290  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.78909e-07  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  87.18 
 
 
156 aa  290  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.27435e-06  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  87.18 
 
 
156 aa  289  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.37083e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  86.54 
 
 
156 aa  288  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.36055e-08  unclonable  3.93257e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  85.26 
 
 
156 aa  287  5e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.90967e-05  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  84.62 
 
 
156 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.54968e-07  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  84.62 
 
 
156 aa  285  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  84.62 
 
 
156 aa  285  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.70066e-09  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  85.26 
 
 
156 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  85.26 
 
 
156 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.35521e-05  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  85.26 
 
 
156 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.56643e-10  hitchhiker  5.16486e-10 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  85.26 
 
 
156 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.08815e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  83.97 
 
 
156 aa  282  1e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.63704e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  78.21 
 
 
156 aa  261  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  75.64 
 
 
156 aa  255  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
156 aa  254  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  75.64 
 
 
156 aa  254  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  75.64 
 
 
156 aa  254  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  76.28 
 
 
156 aa  253  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
156 aa  253  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  76.28 
 
 
156 aa  251  2e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  76.28 
 
 
156 aa  251  2e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  76.28 
 
 
156 aa  251  2e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.84125e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  78.21 
 
 
155 aa  251  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.54252e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.21913e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.39477e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.08281e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.08993e-07  normal  0.106325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.7133e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 
155 aa  249  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.37947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
155 aa  247  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
155 aa  247  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
155 aa  247  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  3.02367e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
155 aa  247  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 
155 aa  247  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1202  hypothetical protein  74.36 
 
 
156 aa  247  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1716  rRNA large subunit methyltransferase  69.87 
 
 
156 aa  244  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004221  hypothetical protein  77.93 
 
 
145 aa  242  1e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000988168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  71.15 
 
 
156 aa  241  4e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1136  rRNA large subunit methyltransferase  71.79 
 
 
156 aa  239  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00404994  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  71.79 
 
 
155 aa  239  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  68.59 
 
 
156 aa  233  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  55.48 
 
 
155 aa  200  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  8.61677e-08 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  58.71 
 
 
155 aa  197  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  53.55 
 
 
155 aa  189  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  53.55 
 
 
155 aa  189  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  52.26 
 
 
155 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  52.26 
 
 
155 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  187  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  187  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  53.55 
 
 
155 aa  183  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  53.85 
 
 
156 aa  182  1e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  50.32 
 
 
156 aa  182  1e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.42803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  177  3e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  3.86318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  54.19 
 
 
156 aa  171  4e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  52.26 
 
 
155 aa  170  6e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 
155 aa  170  7e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.27948e-07  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08380  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 
155 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0699075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 
156 aa  163  7e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  48.97 
 
 
145 aa  162  2e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  1.78654e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  48.39 
 
 
156 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 
156 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 
156 aa  158  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
166 aa  154  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 
156 aa  154  5e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 
156 aa  154  5e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 
156 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  47.44 
 
 
156 aa  153  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  46.79 
 
 
155 aa  153  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  45.81 
 
 
157 aa  153  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 
162 aa  152  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  46.79 
 
 
155 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  46.15 
 
 
155 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  46.79 
 
 
155 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  46.84 
 
 
159 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 
156 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  46.79 
 
 
155 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  48.08 
 
 
156 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  50.32 
 
 
157 aa  151  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  47.74 
 
 
156 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  48.08 
 
 
155 aa  150  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 
156 aa  150  9e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 
157 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1948  rRNA large subunit methyltransferase  44.87 
 
 
156 aa  148  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  46.45 
 
 
156 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 
156 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  46.45 
 
 
156 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 
156 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  47.77 
 
 
156 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  45.16 
 
 
156 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>