More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3147 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  100 
 
 
109 aa  220  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.80611e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  85.19 
 
 
109 aa  191  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.43073e-09  decreased coverage  2.04323e-07 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  83.33 
 
 
109 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.76434e-08  unclonable  3.77675e-11 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  80.37 
 
 
109 aa  188  3e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.43508e-10  hitchhiker  4.78913e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  80.37 
 
 
109 aa  188  3e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.12761e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  79.44 
 
 
114 aa  186  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.16802e-08  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  79.44 
 
 
114 aa  186  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.32969e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  79.44 
 
 
109 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  8.6194e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  78.7 
 
 
115 aa  184  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.5875e-09  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  75.7 
 
 
109 aa  181  2e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  9.71305e-10  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29081e-07  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.84153e-09  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  72.64 
 
 
109 aa  172  2e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.12346e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  71.7 
 
 
108 aa  170  6e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.97602e-10  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  67.92 
 
 
109 aa  158  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.19797e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  65.71 
 
 
105 aa  150  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.04193e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  61.9 
 
 
105 aa  144  4e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  58.49 
 
 
108 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.27237e-08  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.76829e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.22967e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.19857e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12038e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.77395e-11  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  6.79952e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  56.19 
 
 
105 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  130  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  130  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  129  1e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  129  1e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  129  1e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.13985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  56.19 
 
 
105 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.07419e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.95107e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.84258e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  52.38 
 
 
105 aa  127  5e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  52.48 
 
 
105 aa  127  7e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  55.24 
 
 
105 aa  126  9e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  52.38 
 
 
105 aa  125  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  50 
 
 
114 aa  124  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.74363e-11  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  52.48 
 
 
105 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  52.38 
 
 
105 aa  124  4e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  48.11 
 
 
106 aa  124  4e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  53.85 
 
 
130 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  50.48 
 
 
105 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  44.95 
 
 
116 aa  117  4e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  5.27491e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  117  4e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  53.85 
 
 
117 aa  117  5e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  47.22 
 
 
123 aa  114  4e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  54.26 
 
 
148 aa  112  2e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  48.57 
 
 
115 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  50.5 
 
 
117 aa  110  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  53.19 
 
 
148 aa  109  1e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  52.94 
 
 
137 aa  108  2e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0323  hypothetical protein  43.69 
 
 
106 aa  107  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0834924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  43.56 
 
 
123 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  48.08 
 
 
123 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  49.02 
 
 
164 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  45.19 
 
 
122 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  47.96 
 
 
166 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  44.76 
 
 
116 aa  103  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  2.52813e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  46.46 
 
 
112 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  44.76 
 
 
116 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  45.37 
 
 
120 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  47.06 
 
 
119 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  42.31 
 
 
143 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  45.54 
 
 
142 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  46.15 
 
 
128 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  45.28 
 
 
115 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.23789e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  42.57 
 
 
150 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  46.46 
 
 
112 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  41.67 
 
 
121 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  42.59 
 
 
115 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  43.27 
 
 
141 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  38.53 
 
 
135 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  42.57 
 
 
148 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  45.63 
 
 
168 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  44.14 
 
 
134 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.85203e-12  unclonable  1.86984e-10 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  52.88 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  42.72 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  44.66 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  42.72 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  42.86 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  39.62 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  41.67 
 
 
256 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  39.05 
 
 
210 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  43.88 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  43.4 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  6.75973e-07  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  43.81 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  47.22 
 
 
173 aa  97.1  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  47.92 
 
 
128 aa  95.9  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  42 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  44.57 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  40.74 
 
 
241 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  45.05 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>