More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3067 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.71 
 
 
652 aa  703  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  77.37 
 
 
647 aa  998  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.99 
 
 
621 aa  712  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
615 aa  635  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  93.79 
 
 
655 aa  1181  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.17945e-06  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  77.21 
 
 
647 aa  996  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.28036e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  57.99 
 
 
628 aa  707  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.99 
 
 
628 aa  707  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.99 
 
 
628 aa  707  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  85.52 
 
 
657 aa  1142  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.31825e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.44 
 
 
633 aa  643  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.57 
 
 
633 aa  642  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  76.45 
 
 
644 aa  983  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  61.13 
 
 
649 aa  713  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.47 
 
 
638 aa  696  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.5 
 
 
644 aa  786  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  60.88 
 
 
638 aa  699  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.93 
 
 
641 aa  714  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.27 
 
 
617 aa  702  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.9937e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  73.11 
 
 
651 aa  960  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  7.21667e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  77.37 
 
 
647 aa  998  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  68.57 
 
 
640 aa  825  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  85.21 
 
 
657 aa  1137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.56985e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01662  cell division protein FtsH  78.6 
 
 
475 aa  727  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  4.30091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  57.99 
 
 
628 aa  707  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.55 
 
 
656 aa  716  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.48 
 
 
647 aa  822  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.92 
 
 
663 aa  945  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  87.68 
 
 
650 aa  1108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.06538e-06  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  77.21 
 
 
647 aa  996  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.37 
 
 
641 aa  749  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  5.38209e-07  hitchhiker  1.71199e-08 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.76 
 
 
621 aa  706  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.90574e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  70.66 
 
 
660 aa  938  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  86.59 
 
 
657 aa  1145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.61981e-06  hitchhiker  8.32625e-05 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.48 
 
 
673 aa  739  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  7.47191e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  61.82 
 
 
641 aa  767  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.49 
 
 
642 aa  756  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.85 
 
 
640 aa  778  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.87 
 
 
635 aa  652  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.81 
 
 
637 aa  820  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.45 
 
 
612 aa  708  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  77.37 
 
 
647 aa  998  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.44 
 
 
651 aa  830  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.83 
 
 
655 aa  744  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  57.99 
 
 
628 aa  707  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  57.64 
 
 
764 aa  703  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  1.70494e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  61.36 
 
 
639 aa  759  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.43 
 
 
652 aa  691  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  62.52 
 
 
645 aa  773  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.44 
 
 
642 aa  707  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  76.8 
 
 
647 aa  996  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.9949e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  63.69 
 
 
647 aa  808  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.5 
 
 
631 aa  703  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.43 
 
 
631 aa  699  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.99 
 
 
640 aa  754  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  85.52 
 
 
657 aa  1142  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.53792e-06  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.36 
 
 
645 aa  770  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.12 
 
 
640 aa  709  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.58 
 
 
629 aa  714  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.99 
 
 
621 aa  709  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.91 
 
 
634 aa  825  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.31 
 
 
640 aa  712  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.59 
 
 
631 aa  703  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  89.36 
 
 
657 aa  1181  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.20805e-05  hitchhiker  6.81699e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.61 
 
 
640 aa  713  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.75 
 
 
634 aa  827  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  77.03 
 
 
647 aa  996  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.79508e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.46 
 
 
634 aa  775  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  76.92 
 
 
644 aa  988  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.77959e-06  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  76.96 
 
 
647 aa  998  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.70783e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.18 
 
 
626 aa  694  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.98 
 
 
638 aa  674  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.83 
 
 
646 aa  707  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.97526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.29 
 
 
634 aa  654  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.46 
 
 
628 aa  703  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.89 
 
 
651 aa  712  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  85.52 
 
 
657 aa  1142  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.87677e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  69.59 
 
 
642 aa  828  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.81 
 
 
659 aa  795  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.08375e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  63.99 
 
 
646 aa  773  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.61 
 
 
642 aa  712  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 
627 aa  649  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.88844e-07  unclonable  1.75333e-09 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.91 
 
 
635 aa  674  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.62887e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  76.85 
 
 
644 aa  993  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.83259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.1 
 
 
629 aa  703  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
650 aa  1332  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.74852e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  76.94 
 
 
643 aa  983  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.99281e-05  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  88.47 
 
 
659 aa  1188  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.36506e-06  decreased coverage  4.2164e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  77.03 
 
 
647 aa  994  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.24409e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  77.03 
 
 
647 aa  994  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  74.45 
 
 
658 aa  958  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  76.87 
 
 
647 aa  992  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.14537e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  63.69 
 
 
650 aa  806  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.07 
 
 
640 aa  700  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.47 
 
 
641 aa  735  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.75 
 
 
634 aa  826  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.8 
 
 
637 aa  900  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  68.2 
 
 
635 aa  822  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  8.7079e-05  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  68.57 
 
 
641 aa  888  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  8.45189e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  57.99 
 
 
628 aa  707  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>