48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3049 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3049  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  100 
 
 
287 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.84608e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3550  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  78.55 
 
 
277 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.15802e-07  decreased coverage  6.68539e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1215  outer membrane protein OmpK, putative  72.97 
 
 
283 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3379  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  74.57 
 
 
278 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.73921e-08  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1001  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  67.7 
 
 
279 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  9.19402e-10  n/a   
 
 
 
NC_011663  Sbal223_1139  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  68.04 
 
 
283 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.67301e-08  unclonable  4.71998e-12 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2816  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  70 
 
 
277 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  6.31711e-08  unclonable  2.83394e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1040  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  64.95 
 
 
279 aa  358  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.25932e-08  unclonable  7.27651e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1101  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  65.29 
 
 
279 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.52935e-06  unclonable  2.13544e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1036  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  65.29 
 
 
279 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.03481e-08  unclonable  1.47865e-11 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1024  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  63.37 
 
 
295 aa  358  5e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.82973e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2823  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  64.6 
 
 
279 aa  358  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.97906e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3228  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  63.58 
 
 
301 aa  357  1e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.69174e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3367  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  64.43 
 
 
289 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.01971e-07  hitchhiker  0.00176833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3231  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  63.46 
 
 
285 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.039e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1893  nucleoside-specific channel-forming protein  57.62 
 
 
296 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002697  outer membrane protein OmpK  55.68 
 
 
272 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.302081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03287  hypothetical protein  54.21 
 
 
273 aa  272  4e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0110  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  43.64 
 
 
289 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01770  putative nucleoside-binding outer membrane protein  38.59 
 
 
282 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3757  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  32.95 
 
 
319 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4122  nucleoside-specific channel-forming protein  32.76 
 
 
304 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3858  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  32.76 
 
 
319 aa  85.5  1e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.297258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2072  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  31.23 
 
 
293 aa  84.3  2e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0471  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  29.59 
 
 
287 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0451  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  29.59 
 
 
287 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0453  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  29.59 
 
 
287 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0459  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  29.59 
 
 
287 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0513  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  29.59 
 
 
287 aa  81.3  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0493  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  32.37 
 
 
294 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.521942  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0442  nucleoside-specific channel-forming protein  32.37 
 
 
294 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3222  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  32.37 
 
 
294 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  hitchhiker  1.41914e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0445  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  32.37 
 
 
294 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0482  nucleoside-specific channel-forming protein  32.37 
 
 
294 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00359  nucleoside channel, receptor of phage T6 and colicin K  32.37 
 
 
294 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.527354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00363  hypothetical protein  32.37 
 
 
294 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.502644  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  32.37 
 
 
294 aa  76.6  5e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0134636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0332  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  31.79 
 
 
294 aa  75.5  9e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.188825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0879  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  31.4 
 
 
294 aa  73.9  3e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0629  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.81 
 
 
287 aa  73.6  4e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3573  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  26.88 
 
 
286 aa  68.6  1e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.772906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0668  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.83 
 
 
287 aa  68.6  1e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4384  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  23.76 
 
 
286 aa  67  4e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.605519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3759  Nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx-like protein  28.43 
 
 
270 aa  64.7  2e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  24.09 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  24.09 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  24.09 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  24.09 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>