More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2881 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  81.51 
 
 
264 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  83.21 
 
 
275 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  82.82 
 
 
275 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  83.21 
 
 
275 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  83.21 
 
 
275 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  82.58 
 
 
264 aa  454  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  81.51 
 
 
263 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  81.13 
 
 
275 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  81.13 
 
 
275 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  81.51 
 
 
274 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  81.13 
 
 
275 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  81.3 
 
 
275 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  83.79 
 
 
275 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  82.33 
 
 
271 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  81.45 
 
 
266 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  65.11 
 
 
254 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  63.4 
 
 
261 aa  318  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.08 
 
 
251 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  58.02 
 
 
256 aa  315  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.26 
 
 
257 aa  314  9e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.76 
 
 
252 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.76 
 
 
252 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  58.4 
 
 
251 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.76 
 
 
252 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.6 
 
 
253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  63.6 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.6 
 
 
253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.6 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.6 
 
 
253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.6 
 
 
253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.6 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  63.6 
 
 
253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.6 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 
252 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.92 
 
 
252 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.92 
 
 
252 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.92 
 
 
252 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.92 
 
 
252 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.92 
 
 
252 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.08 
 
 
252 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  59.83 
 
 
253 aa  297  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  59.83 
 
 
253 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  58.55 
 
 
246 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  59.39 
 
 
253 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  58.9 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  58.52 
 
 
253 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.05 
 
 
260 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  57.33 
 
 
259 aa  285  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  56.78 
 
 
260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  57.38 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  55.93 
 
 
260 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.17 
 
 
241 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  56.36 
 
 
260 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  56.36 
 
 
260 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  55.08 
 
 
260 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  55.08 
 
 
260 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  56.17 
 
 
260 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  56.17 
 
 
260 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  56.17 
 
 
260 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.17 
 
 
260 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  55.32 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  54.66 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  54.66 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  54.66 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  54.66 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  54.66 
 
 
260 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0532  undecaprenyl diphosphate synthase  56.33 
 
 
253 aa  276  3e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.93 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  54.69 
 
 
251 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.27 
 
 
251 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.27 
 
 
251 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  54.29 
 
 
251 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  55 
 
 
251 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  53.33 
 
 
265 aa  268  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  54.7 
 
 
258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  55.27 
 
 
251 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  55.27 
 
 
251 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  54.85 
 
 
251 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.4 
 
 
261 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  53.78 
 
 
252 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  57.45 
 
 
251 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.63 
 
 
253 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.24 
 
 
252 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.02 
 
 
256 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
258 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  54.27 
 
 
255 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  53.85 
 
 
258 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.42 
 
 
250 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  51.2 
 
 
257 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  52.56 
 
 
244 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.59 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  51.41 
 
 
257 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.01 
 
 
248 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  51.9 
 
 
240 aa  252  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
237 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
237 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  51.46 
 
 
261 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2593  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.52 
 
 
249 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0126809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>