175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2820 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  100 
 
 		 312 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  72.76 
 
 		 316 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  74.33 
 
 		 314 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  73.68 
 
 		 316 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  70.57 
 
 		 317 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  69.94 
 
 		 317 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  69.97 
 
 		 309 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  70.23 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  70.68 
 
 		 316 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  69.16 
 
 		 315 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  69.26 
 
 		 314 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  68.85 
 
 		 315 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  63.12 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  62.78 
 
 		 329 aa  417  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  61.88 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  60.86 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  62.34 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  60.86 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  61.56 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  61.56 
 
 		 329 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  61.56 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  59.38 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  60.55 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  60.86 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  60.19 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  61.59 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  58.54 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  57.05 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  57.05 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  57.05 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  57.05 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  57.61 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  55.13 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  55.13 
 
 		 321 aa  374  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  57.33 
 
 		 322 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  55.88 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  55.45 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  55.81 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  57.82 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  56.45 
 
 		 304 aa  358  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  54.17 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  49.19 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  48.63 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  48.73 
 
 		 287 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  49.04 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  41.3 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  39.79 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  39.62 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  39.07 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  39.29 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  38.6 
 
 		 540 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  38.19 
 
 		 577 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  33.44 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  32.63 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  31.04 
 
 		 337 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  33.44 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  35.13 
 
 		 363 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  33.82 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  37.23 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  32.7 
 
 		 646 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  32.56 
 
 		 259 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.94 
 
 		 658 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  31.33 
 
 		 658 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  31.3 
 
 		 650 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  26.22 
 
 		 658 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  32.45 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  31.91 
 
 		 650 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  31.18 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  26.96 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  26.06 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  33.85 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  28.05 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  31.84 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  29.44 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  26.07 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  27 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  27.2 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  29.02 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  28.67 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  25.11 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  29.15 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  27.71 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  33.59 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  30.19 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  30.2 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  30.2 
 
 		 436 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  32.82 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  35.2 
 
 		 156 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4570  hypothetical protein  53.57 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  29.21 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  28.63 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  35.16 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  28.68 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  30.23 
 
 		 154 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  26.92 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  28.91 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.37 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.37 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>