More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2786 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0573631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.18 
 
 
255 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00108636  hitchhiker  0.000219096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.61 
 
 
255 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0196374  unclonable  0.0000000191957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1674  short chain dehydrogenase family protein  81.38 
 
 
247 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.97 
 
 
258 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.97 
 
 
258 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000108179  normal  0.0377265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.89 
 
 
247 aa  417  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0083444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2774  short chain dehydrogenase family protein  80.97 
 
 
258 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  hitchhiker  0.000224975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.76 
 
 
247 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0183678  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.16 
 
 
247 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0978937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.16 
 
 
247 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0264369  hitchhiker  0.0000000000470617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.16 
 
 
247 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000349992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.1 
 
 
256 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1372  short chain dehydrogenase family protein  66.94 
 
 
274 aa  348  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0570365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1335  short chain dehydrogenase family protein  59.92 
 
 
247 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00551908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
238 aa  174  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
249 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
222 aa  145  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
247 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
260 aa  92  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1221  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.99 
 
 
241 aa  89  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  25 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12310  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.72 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.3676  normal  0.223065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  29.58 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.84 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.62 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  31.41 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  31.41 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  31.41 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.58 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.85 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  28.05 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  27.87 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.71 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.42 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  26.09 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.75 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.52 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.240703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0429  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.22 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.36 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.11 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.767614  hitchhiker  0.00534124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  26.29 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  26.29 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  25.42 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  25.9 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  25.9 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  25.9 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.29 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  25.9 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  25.9 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.7 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  24.9 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  25 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.16 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  25 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.26 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  25.59 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  26.09 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.43 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  24.69 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  24.05 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.43 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  25.83 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  25.48 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  25.31 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.68 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  23.48 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.99 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.63 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.22 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
268 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  25.97 
 
 
265 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.38 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.608737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>