More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2768 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  100 
 
 
399 aa  796    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  81.79 
 
 
394 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  78.97 
 
 
394 aa  618  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  33.42 
 
 
387 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  35.24 
 
 
403 aa  236  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  35.47 
 
 
394 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  33.16 
 
 
397 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.14 
 
 
391 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  31.14 
 
 
409 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.17 
 
 
392 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  30.75 
 
 
400 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  28.85 
 
 
408 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  28.9 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  28.8 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  28 
 
 
414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  28 
 
 
414 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  28.39 
 
 
410 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  29.39 
 
 
410 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  30.23 
 
 
401 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  28.02 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  28 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  28.02 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
394 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  26.75 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  27.78 
 
 
414 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  28.81 
 
 
408 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  31.66 
 
 
407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.97 
 
 
412 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2799  major facilitator transporter  29.67 
 
 
407 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  34.76 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  32.44 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.95 
 
 
402 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.95 
 
 
402 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.85 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0064  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 
397 aa  125  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.834024  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.89 
 
 
398 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  32.06 
 
 
415 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  32.06 
 
 
415 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  32.06 
 
 
415 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.23 
 
 
398 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.65 
 
 
396 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  34.72 
 
 
394 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.21 
 
 
461 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.84 
 
 
393 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.18 
 
 
401 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.18 
 
 
399 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.18 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.53 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  32.47 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  26.55 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  30.92 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.32 
 
 
409 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.29 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.7 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  25.7 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.99 
 
 
405 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  28.65 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  26.7 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.03 
 
 
424 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  29.25 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.73 
 
 
424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.93 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.8 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.48 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.22 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.1 
 
 
414 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
461 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  31.93 
 
 
425 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.25 
 
 
411 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  30.53 
 
 
415 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.57 
 
 
403 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  28.07 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.72 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  28.07 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  28.07 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.62 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  28.07 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  28.07 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  28.07 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
391 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.65 
 
 
396 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  24.47 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  33.19 
 
 
403 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  28.23 
 
 
391 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  28.11 
 
 
392 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  27.32 
 
 
396 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.81 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  27.48 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.27 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.98 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.16 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  28.11 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  25.07 
 
 
392 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.91 
 
 
402 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>