182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2729 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2729  cytochrome B561  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  60.58 
 
 		 247 aa  328  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  63.18 
 
 		 255 aa  316  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  55.79 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  52.03 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  52.03 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  53.01 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  53.63 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  53.82 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  53.82 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  53.82 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1831  cytochrome B561  53.82 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1941  cytochrome b561 family protein  37.23 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00760577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  30.8 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  27.51 
 
 		 387 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  28.38 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  30.9 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  30.26 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  30.04 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  28.25 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  30.47 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  36.96 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  25.32 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0835  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.72 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  30.47 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  25.41 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  30.04 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  28.32 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  26.11 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  27.8 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  27.43 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  27.71 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  26.41 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  28.15 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  27.88 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  28.57 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  29.95 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  28.38 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  28.15 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  28.76 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  26.01 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  29.52 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  27.27 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  27.8 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  31.1 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  31.1 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  31.1 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2054  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.02 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  30.4 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  24.89 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  28.57 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  27.86 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  25.68 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  26.47 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  31.55 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  26.13 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0543  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3330  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.75 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  28.63 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  24.89 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  27.07 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  25.83 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7263  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.8 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  29.6 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  23.14 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0874  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.96 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  25.89 
 
 		 187 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  25.23 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3146  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.63 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  33.1 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  27.94 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  33.58 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  30.14 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  23.85 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  33.6 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  31.2 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  24.22 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  27.95 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  28.21 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2058  cytochrome B561  24.89 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  30.87 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  27.27 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0173  cytochrome B561  25.43 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  33.85 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  22.52 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  31.01 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3770  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.08 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1998  Ni/Fe-hydrogenase, 1 b-type cytochrome subunit  22.04 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2321  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.64 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  27.27 
 
 		 195 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  27.27 
 
 		 195 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  27.27 
 
 		 195 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  31.62 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  27.27 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3987  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.23 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  32.12 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3908  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.1 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  25 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  29.93 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  23.01 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>