91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2697 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  59.66 
 
 		 738 aa  916    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  52.83 
 
 		 724 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  53.01 
 
 		 724 aa  751    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  55.87 
 
 		 729 aa  832    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  51.36 
 
 		 731 aa  722    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  48.08 
 
 		 727 aa  701    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  52.27 
 
 		 730 aa  742    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  51.61 
 
 		 720 aa  728    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  53.8 
 
 		 725 aa  798    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  52.4 
 
 		 731 aa  743    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  52.14 
 
 		 730 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  53.35 
 
 		 722 aa  787    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  53.27 
 
 		 719 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 745 aa  1555    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  52.14 
 
 		 730 aa  741    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  65.31 
 
 		 741 aa  1013    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  58.98 
 
 		 735 aa  872    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  37.03 
 
 		 745 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  36.57 
 
 		 729 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  36.04 
 
 		 716 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  36.84 
 
 		 822 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  25.97 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  25.44 
 
 		 788 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 843 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  26.06 
 
 		 789 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  25.51 
 
 		 789 aa  177  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  25.73 
 
 		 833 aa  173  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  31.98 
 
 		 788 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  25.55 
 
 		 757 aa  151  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24 
 
 		 639 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.8 
 
 		 639 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  29.16 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  24.61 
 
 		 639 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  23.98 
 
 		 639 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  28.61 
 
 		 650 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.55 
 
 		 826 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  23.58 
 
 		 646 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  24.53 
 
 		 639 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  24.77 
 
 		 639 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.85 
 
 		 639 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  29.88 
 
 		 741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  29.4 
 
 		 650 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  29.12 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.44 
 
 		 639 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  28.85 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  28.73 
 
 		 650 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  23.85 
 
 		 639 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.88 
 
 		 898 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  25.43 
 
 		 820 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.3 
 
 		 898 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  22.99 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  26.3 
 
 		 898 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  28.42 
 
 		 782 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  26.53 
 
 		 663 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.01 
 
 		 639 aa  89.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  26.22 
 
 		 656 aa  88.2  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  23.12 
 
 		 731 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  31.28 
 
 		 742 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  30.81 
 
 		 762 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  29.61 
 
 		 742 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.63 
 
 		 766 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  26.38 
 
 		 742 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.71 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  25.98 
 
 		 671 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  25.58 
 
 		 809 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  27.17 
 
 		 885 aa  75.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  24.94 
 
 		 653 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  24.23 
 
 		 655 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  22.6 
 
 		 764 aa  72  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  25.27 
 
 		 667 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  23.32 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.5 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  25.69 
 
 		 945 aa  64.3  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1111 aa  64.3  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  26.33 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  23.98 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  22.77 
 
 		 671 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 		 656 aa  56.6  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.86 
 
 		 936 aa  54.3  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  20.66 
 
 		 764 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  27.98 
 
 		 680 aa  51.6  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  23.93 
 
 		 893 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  21.5 
 
 		 762 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  23.23 
 
 		 754 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  25.11 
 
 		 755 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  20.92 
 
 		 762 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  29.46 
 
 		 657 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  22.99 
 
 		 696 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  22.88 
 
 		 660 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  23.67 
 
 		 854 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  29.23 
 
 		 857 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>