112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2694 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  59.97 
 
 
639 aa  822  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.58979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  60.13 
 
 
639 aa  828  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  60.62 
 
 
639 aa  823  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  63.49 
 
 
639 aa  844  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  61.04 
 
 
639 aa  817  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  60.13 
 
 
639 aa  830  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  61.2 
 
 
639 aa  816  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  67.91 
 
 
646 aa  899  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  100 
 
 
640 aa  1328  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  61.85 
 
 
639 aa  828  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  59.81 
 
 
639 aa  831  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  60.49 
 
 
639 aa  819  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  4.44921e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  34.39 
 
 
650 aa  337  3e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  34.1 
 
 
650 aa  336  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.35795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  34.29 
 
 
650 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  7.31399e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  34.1 
 
 
650 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.05402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  34.87 
 
 
650 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  34.64 
 
 
650 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  34.18 
 
 
656 aa  310  7e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  31.1 
 
 
663 aa  298  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  32.46 
 
 
656 aa  277  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.37992e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  30.68 
 
 
653 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  30.93 
 
 
655 aa  271  3e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  30.54 
 
 
671 aa  259  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  30.28 
 
 
667 aa  246  1e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.045e-05  hitchhiker  6.06277e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  28.1 
 
 
764 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  29.86 
 
 
660 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  29.05 
 
 
671 aa  214  4e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  27.18 
 
 
785 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  27.03 
 
 
714 aa  184  5e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  4.68411e-07 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.56 
 
 
782 aa  143  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  23.85 
 
 
885 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.91 
 
 
826 aa  132  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  25.69 
 
 
822 aa  129  2e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.67 
 
 
731 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.84393e-06  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  23.82 
 
 
735 aa  123  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  25.56 
 
 
742 aa  123  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  25.42 
 
 
742 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  26.46 
 
 
742 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  23.5 
 
 
833 aa  120  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  23.34 
 
 
730 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.52412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  23.34 
 
 
730 aa  120  8e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  23.2 
 
 
730 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.96014e-05  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.38 
 
 
741 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  4.2193e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  22.71 
 
 
893 aa  117  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.82 
 
 
731 aa  116  2e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  24.04 
 
 
764 aa  114  4e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 
745 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.61 
 
 
745 aa  114  7e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  23.37 
 
 
729 aa  113  1e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  22.76 
 
 
722 aa  112  2e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  23.32 
 
 
895 aa  111  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.2 
 
 
719 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  21.77 
 
 
936 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 
727 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  25.29 
 
 
789 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.15 
 
 
789 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  24.13 
 
 
724 aa  103  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.33685e-05  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  22.31 
 
 
738 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  25.25 
 
 
778 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  23.98 
 
 
720 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.08 
 
 
762 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  24.34 
 
 
724 aa  100  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  25.83 
 
 
788 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  24.87 
 
 
754 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  23.85 
 
 
741 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 
725 aa  97.8  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  26.41 
 
 
788 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  27.51 
 
 
898 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  27.2 
 
 
898 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.34 
 
 
755 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  22.83 
 
 
716 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.96 
 
 
764 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  27.3 
 
 
898 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 
761 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.78 
 
 
764 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  8.91097e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.78 
 
 
761 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 
765 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  25.41 
 
 
820 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.9 
 
 
766 aa  91.3  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  22.85 
 
 
762 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  7.40819e-06 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  30.04 
 
 
945 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  28.99 
 
 
843 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  8.08171e-07 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 
770 aa  87.4  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.02 
 
 
762 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.33 
 
 
731 aa  82  3e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  33.33 
 
 
612 aa  81.6  4e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  22.8 
 
 
762 aa  80.5  9e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  6.43351e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  22.85 
 
 
809 aa  79.3  2e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  22.9 
 
 
758 aa  78.2  4e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  35.05 
 
 
642 aa  75.9  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  22.88 
 
 
729 aa  75.1  4e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  2.80036e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  30.41 
 
 
655 aa  70.9  6e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  31.63 
 
 
677 aa  68.9  3e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  28.43 
 
 
700 aa  67.4  7e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  29.29 
 
 
701 aa  66.6  1e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  27.5 
 
 
696 aa  66.6  1e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  29.29 
 
 
701 aa  66.6  1e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  29.29 
 
 
701 aa  67  1e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  28.28 
 
 
698 aa  66.2  2e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>