154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2654 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2654  porin  100 
 
 		 403 aa  809    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  71.25 
 
 		 402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  66.75 
 
 		 403 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  66.34 
 
 		 402 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  66.91 
 
 		 403 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  64.02 
 
 		 388 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  63.97 
 
 		 403 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  64.22 
 
 		 403 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  63.73 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  63.97 
 
 		 403 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  62.75 
 
 		 402 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  63.26 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  62.53 
 
 		 402 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  62.53 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  59.71 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  62.5 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  61.73 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  51.61 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  34.87 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  35.9 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  32.52 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  35.75 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  34.47 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  32.76 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  32.76 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  34.23 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  34.23 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  32.52 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  33.99 
 
 		 384 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  32.76 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  35.04 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  33.17 
 
 		 389 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  33.74 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  27.8 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  33.71 
 
 		 324 aa  93.2  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  27.09 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  24.72 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  32.91 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  34.97 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  24.16 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  24.64 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  27.23 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  25.53 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  29.88 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  24.22 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  32.87 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  24.76 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  25.29 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  25.29 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  25.29 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  22.54 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  23.43 
 
 		 360 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0558  outer membrane protein  26.32 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  22.04 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0617  outer membrane protein  26.32 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0573  outer membrane protein  26.32 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  23.39 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  22.82 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  22.3 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  23.63 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  23.39 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0971  putative outer membrane protein  25.2 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  24.53 
 
 		 362 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0563  outer membrane protein  26.04 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  24.53 
 
 		 362 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  24.53 
 
 		 362 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0556  outer membrane protein  26.04 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  28.89 
 
 		 333 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  24.29 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  23.76 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  31.47 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  34.78 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  24.7 
 
 		 364 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  26.71 
 
 		 331 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  23.76 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  25 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01348  outer membrane pore protein N, non-specific  25.25 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1614  outer membrane protein N  25.25 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.51983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  25.25 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  25.25 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  23.76 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  23.76 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  23.76 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  25.25 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  25.25 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3398  putative outer membrane protein  28.05 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26411  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2269  porin Gram-negative type  25.25 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.421789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  24.76 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  25.76 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  24.76 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  25.76 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  25.76 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  25.76 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  25.76 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  23.52 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  24.88 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  24.88 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  24.88 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  32.06 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  32.06 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>