17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2597 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2597  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2424  hypothetical protein  50.88 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.13368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1630  hypothetical protein  43.86 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97673  normal  0.0442479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3025  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256458  normal  0.331353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3087  hypothetical protein  38.89 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2675  hypothetical protein  46.3 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2166  hypothetical protein  55.56 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2458  hypothetical protein  45.16 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2759  hypothetical protein  46.67 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1531  hypothetical protein  45.45 
 
 
66 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2777  hypothetical protein  47.46 
 
 
66 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.627073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2854  hypothetical protein  47.46 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1599  hypothetical protein  41.27 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00429236  hitchhiker  0.000564563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1474  hypothetical protein  38.46 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1409  hypothetical protein  38.46 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1462  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000246268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02699  hypothetical protein  39.13 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>