More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2484 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  66.88 
 
 		 308 aa  424  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  69.54 
 
 		 302 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  67.22 
 
 		 299 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  66.56 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  67 
 
 		 303 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  67.33 
 
 		 303 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  67.88 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  67.33 
 
 		 303 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  67 
 
 		 303 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  67.88 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  66.22 
 
 		 299 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  66.56 
 
 		 302 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  63 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2284  ABC transporter related  59.53 
 
 		 298 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  55.3 
 
 		 301 aa  329  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  35.18 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  37.8 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  39.04 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.63 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  40.95 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  31.72 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  28.63 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.32 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  30.39 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.85 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  36.36 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  37.62 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  34.16 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  35.94 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0617  ABC transporter related  37.02 
 
 		 243 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.854528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  34.38 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.65 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.24 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.76 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  36.15 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  34.76 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  36.28 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  32.59 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 241 aa  142  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  34.56 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  36.93 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  34.76 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  34.29 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  36.41 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  32.72 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  39.17 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  28.2 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.06 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  38.73 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  38.07 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  34.29 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  36.06 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  37.79 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.68 
 
 		 944 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.54 
 
 		 373 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  32.82 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.32 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  40 
 
 		 1010 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  36.54 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  32.17 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  30.82 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  31.73 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 814 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  39.23 
 
 		 236 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  34.05 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  38.46 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  31.77 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.41 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.54 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  32.54 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.48 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  36.06 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  36.06 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  30.49 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  30.16 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.16 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  36.19 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  30.16 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2294  ABC transporter related  33.33 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  28.67 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  36.54 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  27.81 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  30.16 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  35.29 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  35.29 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  36.7 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  36.04 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  27.7 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>