More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2407 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  71.4 
 
 
517 aa  771  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  61.7 
 
 
515 aa  655  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.5439e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  61.7 
 
 
515 aa  654  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.80518e-05  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
519 aa  1068  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.06679e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  72.12 
 
 
519 aa  778  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  61.21 
 
 
515 aa  653  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.91622e-07  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  60.89 
 
 
515 aa  642  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  61.9 
 
 
515 aa  657  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  59.31 
 
 
514 aa  637  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.57284e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  68.85 
 
 
511 aa  744  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.01549e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  60.82 
 
 
515 aa  651  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.5187e-05  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  61.54 
 
 
519 aa  655  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  60.82 
 
 
515 aa  650  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.90674e-05  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  52.91 
 
 
517 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  51.54 
 
 
518 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.99101e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  52.62 
 
 
552 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  51.27 
 
 
517 aa  538  1e-152  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  54.14 
 
 
554 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  51.09 
 
 
553 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  49.81 
 
 
527 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  49.71 
 
 
528 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  52.61 
 
 
485 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  47.61 
 
 
532 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  52.79 
 
 
474 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.09 
 
 
543 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.44434e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  48.39 
 
 
580 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  49.52 
 
 
495 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.59239e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  46.54 
 
 
548 aa  452  1e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  7.79386e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  44.32 
 
 
539 aa  453  1e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  46.32 
 
 
556 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  46.78 
 
 
524 aa  448  1e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  42.64 
 
 
550 aa  395  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.31 
 
 
534 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.39 
 
 
515 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  38.28 
 
 
498 aa  353  3e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  36.88 
 
 
534 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.97 
 
 
530 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  40.35 
 
 
479 aa  339  9e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  40.13 
 
 
479 aa  338  2e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
527 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  36.93 
 
 
546 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.11 
 
 
475 aa  308  1e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.18 
 
 
472 aa  304  3e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.18 
 
 
459 aa  304  3e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.54 
 
 
499 aa  303  4e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  36.32 
 
 
487 aa  301  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.03 
 
 
395 aa  301  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.29 
 
 
457 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.29 
 
 
457 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  36.54 
 
 
476 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  37.75 
 
 
442 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  36.54 
 
 
476 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  36.34 
 
 
476 aa  290  5e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.93 
 
 
464 aa  289  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  37.5 
 
 
442 aa  289  9e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  36.34 
 
 
518 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.18 
 
 
465 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  35.04 
 
 
474 aa  287  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  35.51 
 
 
474 aa  286  6e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  34.83 
 
 
474 aa  286  6e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  35.64 
 
 
473 aa  283  5e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  33.84 
 
 
477 aa  280  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  34.39 
 
 
492 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  36.08 
 
 
452 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.08 
 
 
452 aa  279  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.08 
 
 
452 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.08 
 
 
452 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.08 
 
 
452 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.08 
 
 
452 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  35.45 
 
 
471 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.18 
 
 
455 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.72 
 
 
406 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.72 
 
 
406 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  33.75 
 
 
483 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.72 
 
 
406 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.72 
 
 
406 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.72 
 
 
406 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.02 
 
 
455 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.72 
 
 
406 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  33.75 
 
 
483 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  34.75 
 
 
483 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  34.13 
 
 
539 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  33.96 
 
 
483 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  37.28 
 
 
446 aa  266  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  33.75 
 
 
501 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  37.22 
 
 
445 aa  260  5e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  41 
 
 
426 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  35.75 
 
 
547 aa  253  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  36.48 
 
 
578 aa  253  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.83 
 
 
612 aa  249  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 
612 aa  249  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 
467 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  36.2 
 
 
557 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 
504 aa  245  1e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  35.12 
 
 
511 aa  245  2e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  35.7 
 
 
570 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 
504 aa  243  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  34.86 
 
 
516 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  33.58 
 
 
515 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  35.43 
 
 
516 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>