27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2401 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2401  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  905  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.96992e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2606  hypothetical protein  54.79 
 
 
438 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.05576e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2203  hypothetical protein  53.59 
 
 
445 aa  470  1e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.81796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1994  hypothetical protein  55.84 
 
 
438 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  8.45172e-07  hitchhiker  2.03424e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2110  hypothetical protein  56.69 
 
 
440 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.34469e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2016  hypothetical protein  55.45 
 
 
457 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.39386e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2322  hypothetical protein  55.2 
 
 
457 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0247486  hitchhiker  4.07236e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2001  hypothetical protein  55.45 
 
 
457 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.25665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2064  hypothetical protein  54.95 
 
 
457 aa  418  1e-115  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000323531  hitchhiker  0.000809606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2017  hypothetical protein  53.41 
 
 
440 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1781  hypothetical protein  53.22 
 
 
455 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.5299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2233  hypothetical protein  54.37 
 
 
474 aa  407  1e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.34383e-06  normal  0.29326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2156  hypothetical protein  54.7 
 
 
474 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.72621e-08  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2557  hypothetical protein  52.9 
 
 
479 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1879  hypothetical protein  53.77 
 
 
439 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00596429  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2364  hypothetical protein  53.3 
 
 
394 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.33583e-08  hitchhiker  0.00524599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2363  hypothetical protein  29.87 
 
 
481 aa  186  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  1.5183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2256  hypothetical protein  30.3 
 
 
455 aa  175  1e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02387  hypothetical protein  32.4 
 
 
498 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000501631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1824  hypothetical protein  29.13 
 
 
419 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2397  hypothetical protein  34.62 
 
 
420 aa  149  1e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002774  hypothetical protein  26.79 
 
 
416 aa  138  3e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03209  hypothetical protein  34.04 
 
 
416 aa  126  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  25.17 
 
 
787 aa  67.4  5e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  23.87 
 
 
625 aa  65.5  2e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  24.68 
 
 
596 aa  62.4  1e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  23.74 
 
 
715 aa  58.2  3e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>