184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2237 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  68.78 
 
 
599 aa  877  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  75.51 
 
 
590 aa  937  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  74.75 
 
 
590 aa  946  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  76.18 
 
 
590 aa  947  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  71.58 
 
 
595 aa  870  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  76.52 
 
 
590 aa  950  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  75.08 
 
 
596 aa  937  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  74.66 
 
 
592 aa  928  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  3.7575e-05  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  74.66 
 
 
596 aa  940  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  75.17 
 
 
596 aa  941  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  76.48 
 
 
591 aa  962  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  100 
 
 
590 aa  1228  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  5.89696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  76.01 
 
 
590 aa  944  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  75 
 
 
592 aa  935  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  70.13 
 
 
609 aa  887  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  5.6708e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  75.17 
 
 
592 aa  938  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  34.96 
 
 
602 aa  320  4e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  32.92 
 
 
582 aa  299  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  30.96 
 
 
578 aa  280  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  28.76 
 
 
635 aa  253  9e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  29.71 
 
 
542 aa  246  1e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  29.33 
 
 
536 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  27.44 
 
 
542 aa  213  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  27.08 
 
 
554 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  25.98 
 
 
548 aa  184  5e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  27.16 
 
 
628 aa  183  9e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  26.6 
 
 
575 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  25.22 
 
 
581 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  25.32 
 
 
540 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  25.37 
 
 
613 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  22.56 
 
 
554 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  23.7 
 
 
543 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  26.83 
 
 
496 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  20.96 
 
 
614 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  25.57 
 
 
502 aa  99.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  27.33 
 
 
506 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  22.36 
 
 
583 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  25.29 
 
 
522 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  21.64 
 
 
617 aa  94.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  23.37 
 
 
627 aa  94  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  22.51 
 
 
616 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.81618e-06  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  21.35 
 
 
618 aa  89.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.60677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  24.94 
 
 
625 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  31.58 
 
 
621 aa  88.6  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  21.64 
 
 
615 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  21.76 
 
 
613 aa  89  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.82029e-06  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  25.29 
 
 
605 aa  88.2  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  31.67 
 
 
610 aa  87.8  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  21.39 
 
 
615 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  25.18 
 
 
607 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  5.15921e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  24.32 
 
 
595 aa  87.4  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  25.18 
 
 
607 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  25.18 
 
 
607 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  25.45 
 
 
610 aa  87  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  23.64 
 
 
587 aa  87  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  21.47 
 
 
616 aa  86.7  1e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  21.47 
 
 
616 aa  86.7  1e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.02664e-05  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  21.47 
 
 
616 aa  86.7  1e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.23999e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  21.87 
 
 
615 aa  86.3  1e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  20.6 
 
 
628 aa  85.5  2e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  28.76 
 
 
605 aa  85.9  2e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  21.78 
 
 
615 aa  85.1  3e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  24.69 
 
 
624 aa  85.1  4e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.99463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  31.98 
 
 
629 aa  84.7  5e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  21.98 
 
 
617 aa  84.3  6e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  26.99 
 
 
607 aa  83.2  1e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  30.59 
 
 
635 aa  83.2  1e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  26.5 
 
 
609 aa  83.6  1e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  25.21 
 
 
621 aa  83.2  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  23.99 
 
 
544 aa  82  2e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  26.2 
 
 
616 aa  82.8  2e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  23.6 
 
 
619 aa  82.4  2e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  24.51 
 
 
614 aa  82.4  2e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  28.5 
 
 
614 aa  82.4  2e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  23.04 
 
 
609 aa  81.3  4e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  28.5 
 
 
614 aa  81.6  4e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  24.41 
 
 
594 aa  81.3  4e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  30 
 
 
635 aa  81.6  4e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  23.26 
 
 
608 aa  81.6  4e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  30 
 
 
635 aa  81.6  4e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  27.11 
 
 
609 aa  81.3  5e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  28.04 
 
 
611 aa  80.5  9e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.85801e-09 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  24.23 
 
 
603 aa  80.1  1e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  24.68 
 
 
622 aa  79.7  1e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  24.23 
 
 
603 aa  80.1  1e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  28.04 
 
 
609 aa  80.1  1e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  6.339e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  28.04 
 
 
609 aa  80.1  1e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  24.23 
 
 
603 aa  80.1  1e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26014e-10 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  23.59 
 
 
609 aa  79.7  1e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  24.23 
 
 
603 aa  80.1  1e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  25.78 
 
 
646 aa  80.1  1e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  29.82 
 
 
227 aa  80.1  1e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  30.11 
 
 
616 aa  79.7  1e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.86308e-06  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  24.23 
 
 
603 aa  80.1  1e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  27.93 
 
 
589 aa  79.3  2e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  27.31 
 
 
611 aa  79  2e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.55519e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  21.63 
 
 
602 aa  79  2e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  24.43 
 
 
611 aa  79.3  2e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  28.04 
 
 
614 aa  79.7  2e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  27.92 
 
 
592 aa  78.2  4e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>