285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2172 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.26 
 
 
557 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  65.21 
 
 
551 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.83 
 
 
555 aa  693    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0276  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.07 
 
 
549 aa  737    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001581  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.94 
 
 
553 aa  654    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0086  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.17 
 
 
549 aa  748    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0288135  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.26 
 
 
557 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.26 
 
 
581 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.58 
 
 
560 aa  766    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.98 
 
 
553 aa  749    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.44 
 
 
557 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  64.72 
 
 
549 aa  759    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  58.26 
 
 
557 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0280  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.07 
 
 
549 aa  738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.08 
 
 
557 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.85 
 
 
551 aa  754    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1956  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.47 
 
 
610 aa  658    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.12 
 
 
547 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.92 
 
 
548 aa  651    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.14 
 
 
562 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.95 
 
 
544 aa  762    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.26 
 
 
557 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.31 
 
 
554 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.8 
 
 
557 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.44 
 
 
557 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.44 
 
 
557 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05546  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.76 
 
 
554 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15160  electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxido-reductase  65.69 
 
 
550 aa  754    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.83 
 
 
545 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.12 
 
 
554 aa  768    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.71 
 
 
557 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.86 
 
 
554 aa  745    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4794  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.53 
 
 
549 aa  741    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0795464  hitchhiker  0.00000316317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  61.38 
 
 
545 aa  714    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16430  Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  68.12 
 
 
549 aa  802    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0960517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.89 
 
 
557 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.89 
 
 
557 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.71 
 
 
563 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.89 
 
 
558 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.99 
 
 
548 aa  735    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000799115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.25 
 
 
549 aa  742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.4 
 
 
554 aa  768    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.7 
 
 
551 aa  743    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.71 
 
 
555 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2251  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.96 
 
 
545 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196943  normal  0.137655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2172  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
548 aa  1136    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.17 
 
 
557 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.98 
 
 
557 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2147  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.42 
 
 
549 aa  761    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.962634  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.17 
 
 
557 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.26 
 
 
581 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.35 
 
 
549 aa  756    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.35 
 
 
549 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0081  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.99 
 
 
549 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.62 
 
 
557 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.35 
 
 
557 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.85 
 
 
551 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.17 
 
 
557 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.98 
 
 
557 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.23 
 
 
549 aa  701    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.58 
 
 
560 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4403  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.44 
 
 
549 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.53 
 
 
549 aa  757    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.17 
 
 
557 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.87 
 
 
550 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.73 
 
 
550 aa  744    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17400  Electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxidoreductase  68.67 
 
 
549 aa  808    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.81 
 
 
568 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.17 
 
 
556 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.26 
 
 
557 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000406  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.56 
 
 
540 aa  691    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.453642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0284  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.25 
 
 
549 aa  739    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.26 
 
 
557 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4121  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.62 
 
 
549 aa  744    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.98 
 
 
557 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.07 
 
 
549 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.81 
 
 
557 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.94 
 
 
533 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.27 
 
 
549 aa  625  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.7 
 
 
558 aa  623  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.26 
 
 
556 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.97 
 
 
561 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.35 
 
 
551 aa  623  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.56 
 
 
556 aa  623  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.64 
 
 
568 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.06 
 
 
561 aa  618  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.67 
 
 
545 aa  616  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.83 
 
 
566 aa  617  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.64 
 
 
568 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1988  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.95 
 
 
545 aa  613  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3289  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.66 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.16 
 
 
562 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.5 
 
 
569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4163  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.15 
 
 
572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2269  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.15 
 
 
587 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3018  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.15 
 
 
572 aa  601  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0545377  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.8 
 
 
561 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.43 
 
 
591 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.8 
 
 
561 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.125425  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2679  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.33 
 
 
561 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>