114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2135 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 397 aa  822    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  37.27 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 377 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  25.75 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.07 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  23.68 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  27.16 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  27.24 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  19.89 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  29.57 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  22.19 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  23.99 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 329 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 188 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  23.08 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  24.58 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  24.91 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  21.35 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 191 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  24.9 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  24.9 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  25.1 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  29.67 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  23.71 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  24.07 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  22.08 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  23.91 
 
 		 187 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 363 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  21.67 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  24.57 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  21.34 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  23.61 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  22.34 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  40.51 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 191 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  33.82 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  33.82 
 
 		 211 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2824  transcriptional regulator, LuxR response regulator receiver  35.62 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.69 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  20.16 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3324  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  20.16 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  21.32 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 151 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 368 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 176 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  27.96 
 
 		 128 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>