More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2133 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  71.08 
 
 
249 aa  362  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.67 
 
 
249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  349  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  344  7e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  343  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
267 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  67.87 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  341  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  341  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  341  8e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.86 
 
 
249 aa  340  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  66.27 
 
 
249 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  340  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.46 
 
 
249 aa  338  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.98 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  66.67 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  64.26 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.86 
 
 
249 aa  334  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  333  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  66.27 
 
 
249 aa  333  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  332  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  332  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  331  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  331  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  330  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  330  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  63.1 
 
 
252 aa  330  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  329  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  64.26 
 
 
249 aa  329  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  64.26 
 
 
249 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.84 
 
 
249 aa  328  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  63.05 
 
 
251 aa  328  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  62.85 
 
 
253 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.85 
 
 
253 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  63.45 
 
 
250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  325  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  325  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.24 
 
 
253 aa  324  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  324  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.06 
 
 
253 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  62.65 
 
 
249 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.1 
 
 
252 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  322  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  63.05 
 
 
250 aa  322  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
271 aa  322  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  321  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  320  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.85 
 
 
251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  64.26 
 
 
249 aa  318  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  318  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1290  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  317  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0308703  normal  0.0442598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  62.55 
 
 
249 aa  316  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  316  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  315  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.04 
 
 
249 aa  315  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.64 
 
 
446 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>