More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2127 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  41.79 
 
 		 771 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  57.54 
 
 		 810 aa  847    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  43.2 
 
 		 784 aa  648    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  56.54 
 
 		 820 aa  884    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  41.77 
 
 		 772 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  42 
 
 		 771 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  42 
 
 		 771 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  42.52 
 
 		 768 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  41.87 
 
 		 771 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  42.06 
 
 		 769 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  42.91 
 
 		 770 aa  634  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  41.91 
 
 		 767 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  42.4 
 
 		 767 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  41.11 
 
 		 771 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  41.61 
 
 		 768 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  41.11 
 
 		 771 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  42.14 
 
 		 784 aa  621  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  41.11 
 
 		 771 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  40.75 
 
 		 794 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  41.11 
 
 		 771 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  41.31 
 
 		 772 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  41.22 
 
 		 771 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  41.48 
 
 		 771 aa  608  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  39.36 
 
 		 796 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  41.17 
 
 		 795 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  40.18 
 
 		 799 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  39.72 
 
 		 799 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  40.33 
 
 		 787 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  40.18 
 
 		 799 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  40.05 
 
 		 799 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  39.7 
 
 		 793 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  39.77 
 
 		 790 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  39.95 
 
 		 796 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  39.57 
 
 		 787 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  38.88 
 
 		 821 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  38.92 
 
 		 821 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  39.38 
 
 		 794 aa  552  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  38.63 
 
 		 799 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  40.08 
 
 		 813 aa  545  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  39.95 
 
 		 826 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  37.52 
 
 		 808 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  38.05 
 
 		 831 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  38.42 
 
 		 786 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  36.94 
 
 		 827 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  35.87 
 
 		 834 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  37.48 
 
 		 783 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  36.74 
 
 		 786 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  37.74 
 
 		 808 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  38.02 
 
 		 786 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  39.32 
 
 		 799 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  38.02 
 
 		 786 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  38.11 
 
 		 804 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  37.13 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  37.56 
 
 		 786 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  37 
 
 		 786 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  37 
 
 		 786 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  36.86 
 
 		 797 aa  488  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  37.79 
 
 		 813 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  36.92 
 
 		 786 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  37.45 
 
 		 804 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  37.38 
 
 		 813 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  37.79 
 
 		 809 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  26.78 
 
 		 797 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  25.87 
 
 		 791 aa  270  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  26.59 
 
 		 792 aa  260  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  27.43 
 
 		 799 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  27.07 
 
 		 808 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  24.78 
 
 		 790 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.39 
 
 		 796 aa  244  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.08 
 
 		 806 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  23.95 
 
 		 805 aa  207  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.28 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.28 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  23.9 
 
 		 830 aa  197  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.89 
 
 		 764 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.25 
 
 		 1051 aa  115  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.73 
 
 		 831 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.16 
 
 		 755 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.88 
 
 		 788 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.02 
 
 		 773 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.09 
 
 		 864 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.07 
 
 		 804 aa  88.6  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.19 
 
 		 803 aa  88.6  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  19.91 
 
 		 923 aa  79.7  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.82 
 
 		 752 aa  78.6  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  19.74 
 
 		 842 aa  77.8  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.5 
 
 		 758 aa  73.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.35 
 
 		 767 aa  73.2  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  21.63 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  20.45 
 
 		 689 aa  72.4  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  19.96 
 
 		 692 aa  71.6  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  29.14 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.08 
 
 		 727 aa  70.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  19.61 
 
 		 811 aa  70.9  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  29.37 
 
 		 905 aa  68.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.83 
 
 		 808 aa  68.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  22.56 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.74 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  25.5 
 
 		 874 aa  67  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>