55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2108 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  100 
 
 
93 aa  190  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  58.06 
 
 
93 aa  112  2e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.81262e-05  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  58.06 
 
 
93 aa  112  2e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  58.06 
 
 
93 aa  112  2e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  58.06 
 
 
93 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  59.14 
 
 
93 aa  111  4e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  59.14 
 
 
93 aa  111  4e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.9534e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  59.14 
 
 
93 aa  111  4e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.67344e-08  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  59.14 
 
 
93 aa  111  4e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.86637e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  59.14 
 
 
93 aa  111  4e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.77209e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  51.61 
 
 
93 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.56489e-05  hitchhiker  9.66631e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  48.45 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  50.54 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  9.31832e-08  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  50 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  48.04 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2133  DsrH family protein  55.07 
 
 
71 aa  73.6  9e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0139279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  40.62 
 
 
98 aa  61.6  3e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1706  DsrH family protein  35.05 
 
 
97 aa  60.1  9e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  5.13619e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1333  intracellular sulfur oxidation protein DsrH  35.35 
 
 
102 aa  58.5  3e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2601  hypothetical protein  35.42 
 
 
101 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  35.42 
 
 
101 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  36.46 
 
 
99 aa  57.8  5e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  38.54 
 
 
99 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1950  DsrH protein  34.02 
 
 
97 aa  57.4  6e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  37.76 
 
 
99 aa  55.1  3e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0042  DsrH protein  33.67 
 
 
97 aa  54.3  5e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.932533  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2315  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.9 
 
 
97 aa  54.3  6e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1851  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.67 
 
 
97 aa  53.5  9e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  5.63388e-05  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  39.18 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  39.18 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  37.89 
 
 
97 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3441  intracellular sulfur oxidation protein of DsrH family protein  35.71 
 
 
96 aa  50.4  7e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  hitchhiker  0.000104159 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2189  sulfur relay protein TusB/DsrH  28.28 
 
 
100 aa  50.1  1e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.62558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0315  sulfur relay protein TusB/DsrH  36.46 
 
 
95 aa  49.3  2e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000131562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2481  DsrH protein  31.63 
 
 
99 aa  48.5  3e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1965  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0701  sulfur relay protein TusB/DsrH  29.9 
 
 
97 aa  47.4  6e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0938457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0134  DsrH family protein  29.7 
 
 
97 aa  47  9e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00043522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1521  hypothetical protein  29.67 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0035  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.96 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  35.42 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1657  DsrH family protein  32.32 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3600  sulfur relay protein TusB/DsrH  39.18 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1923  hypothetical protein  30.53 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.597175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0397  sulfur relay protein TusB/DsrH  31.25 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  2.47543e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3679  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.4763e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3922  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.20645e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4011  sulfur relay protein TusB/DsrH  32.99 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000192762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0274  sulfur transfer complex subunit TusB  33.33 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4552  sulfur transfer complex subunit TusB  32.29 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.46848e-08  normal  0.147371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4652  sulfur transfer complex subunit TusB  30.61 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.3417e-09  normal  0.021154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03194  predicted intracellular sulfur oxidation protein  30.61 
 
 
95 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.36461e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3539  sulfur transfer complex subunit TusB  30.61 
 
 
95 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.07691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03145  hypothetical protein  30.61 
 
 
95 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.56644e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3812  sulfur transfer complex subunit TusB  30.61 
 
 
95 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.71307e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3717  sulfur transfer complex subunit TusB  30.61 
 
 
95 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.4476e-14  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>