24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2105 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2105  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2227  hypothetical protein  52.21 
 
 		 276 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2394  hypothetical protein  51.47 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.265059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2001  hypothetical protein  49.43 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424573  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1807  hypothetical protein  49.62 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067407  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1941  hypothetical protein  46.47 
 
 		 276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305518  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4503  hypothetical protein  49.82 
 
 		 299 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2217  hypothetical protein  49.82 
 
 		 299 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000011736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2230  hypothetical protein  49.82 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00147411  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2154  hypothetical protein  48.89 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000926677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2204  hypothetical protein  48.15 
 
 		 299 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000217456  normal  0.223194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2346  hypothetical protein  48.3 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1890  hypothetical protein  48.85 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00358121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1953  hypothetical protein  46.84 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000171054  hitchhiker  0.00261274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2123  hypothetical protein  47.21 
 
 		 295 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000221039  normal  0.0151764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2022  hypothetical protein  47.21 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  hitchhiker  0.00000213318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1792  hypothetical protein  44.76 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.974933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1639  hypothetical protein  33.16 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01257  hypothetical protein  31.68 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03047  hypothetical protein  32.29 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2343  putative lipoprotein  31.74 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002910  hypothetical protein  32.46 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000567141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1583  putative lipoprotein  27.67 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000549733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1851  hypothetical protein  28.92 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>