45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2075 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2075  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  211  3e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.13824e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2296  hypothetical protein  71.57 
 
 
96 aa  137  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.00434e-08  unclonable  6.69948e-11 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2313  hypothetical protein  69.61 
 
 
96 aa  134  3e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.79262e-07  hitchhiker  2.95162e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1956  hypothetical protein  63.3 
 
 
109 aa  132  1e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.44171e-09  unclonable  3.01378e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2121  hypothetical protein  57.14 
 
 
102 aa  115  1e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  8.51455e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2040  hypothetical protein  65.91 
 
 
91 aa  115  2e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  8.97334e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1979  hypothetical protein  64.37 
 
 
91 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.59303e-09  unclonable  3.85567e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2052  hypothetical protein  64.37 
 
 
91 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.67533e-07  unclonable  2.24709e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1926  hypothetical protein  64.37 
 
 
91 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.17351e-10  unclonable  2.4862e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2394  hypothetical protein  65.52 
 
 
91 aa  109  1e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.69455e-08  unclonable  8.27601e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2277  hypothetical protein  65.52 
 
 
91 aa  109  1e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  9.08529e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2072  hypothetical protein  65.52 
 
 
91 aa  109  1e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.44541e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2068  protein of unknown function DUF1049  65.52 
 
 
91 aa  108  2e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.3154e-08  unclonable  1.36628e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2400  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1755  hypothetical protein  56.99 
 
 
93 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.4676e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1738  membrane protein  56 
 
 
113 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.54763e-07  hitchhiker  0.00236819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1838  hypothetical protein  35 
 
 
102 aa  66.2  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00855193  hitchhiker  0.000200494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1440  hypothetical protein  35 
 
 
102 aa  66.2  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.68816e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1621  hypothetical protein  35 
 
 
102 aa  66.2  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000478704  decreased coverage  6.99573e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1833  hypothetical protein  35 
 
 
102 aa  66.2  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00320514  unclonable  4.90443e-31 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1896  hypothetical protein  35 
 
 
102 aa  66.2  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00137818  hitchhiker  2.45315e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1507  hypothetical protein  36.56 
 
 
102 aa  66.2  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.88419e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2368  protein of unknown function DUF1049  36.56 
 
 
102 aa  66.2  2e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.48025e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1850  hypothetical protein  36.56 
 
 
102 aa  66.2  2e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.37894e-07  unclonable  2.67694e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1913  hypothetical protein  36.56 
 
 
102 aa  65.5  2e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.66847e-07  unclonable  1.58783e-24 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1481  hypothetical protein  36.56 
 
 
102 aa  66.2  2e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.97694e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1390  hypothetical protein  36.56 
 
 
102 aa  66.2  2e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.11477e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2347  hypothetical protein  36.56 
 
 
102 aa  66.2  2e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  1.0556e-06  unclonable  1.629e-08 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01256  conserved inner membrane protein  36.56 
 
 
102 aa  66.2  2e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000209793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01267  hypothetical protein  36.56 
 
 
102 aa  66.2  2e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000287085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2189  hypothetical protein  34.74 
 
 
102 aa  64.3  5e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000588591  hitchhiker  4.14768e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1734  protein of unknown function DUF1049  34.31 
 
 
102 aa  64.3  5e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  8.18234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2368  hypothetical protein  34.09 
 
 
101 aa  62  3e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2027  hypothetical protein  35.71 
 
 
103 aa  59.7  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.38978e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2233  hypothetical protein  35.71 
 
 
103 aa  59.7  1e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.93542e-08  hitchhiker  0.00232657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1916  hypothetical protein  35.71 
 
 
103 aa  59.7  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.9637e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2642  protein of unknown function DUF1049  34.09 
 
 
101 aa  58.5  3e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  1.64462e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2651  hypothetical protein  35.44 
 
 
100 aa  56.2  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.05401e-06  unclonable  3.05999e-08 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1701  protein of unknown function DUF1049  33.33 
 
 
101 aa  51.2  5e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  4.46702e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3011  hypothetical protein  37.88 
 
 
95 aa  49.7  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000562195  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2223  inner membrane protein  27.47 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  1.12515e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003022  membrane protein  42.11 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.51308e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02858  hypothetical protein  42.11 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1503  hypothetical protein  35.38 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.56233e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0299  hypothetical protein  34.21 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>