166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2018 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  100 
 
 		 408 aa  838    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  49.16 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  29.96 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.45 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.95 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  26.6 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  27.46 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.31 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  23.21 
 
 		 424 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.18 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.28 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.29 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  23.99 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.2 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.45 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  26.2 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  25.82 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  24.29 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.56 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  23.4 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  24.41 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  22.57 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.8 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  23.36 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  25.52 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  24.07 
 
 		 587 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  22.91 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  25.52 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  21.7 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.27 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.96 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  22.88 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  20.85 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  26.85 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  21.09 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  21.46 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.51 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  21.46 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  22.63 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  21.55 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  21.55 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  21.55 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  21.55 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  21.55 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  28.22 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  26.82 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  25.44 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  21.36 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  21.36 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  21.21 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  22.77 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  25.42 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  25.94 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  25.44 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  20.5 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  24.4 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  23.7 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  24.9 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  21.28 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  18.93 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  23.96 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  24.43 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  29.67 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  19.42 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  26.03 
 
 		 273 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.22 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  26.34 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  23.85 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.68 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  20.27 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  20.57 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.45 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  24.43 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  24.05 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0308  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  23.66 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  22.76 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.35 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  21.54 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  26.29 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2044  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.274196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  21.3 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  21.9 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  20.77 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.39 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  21.05 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  20.12 
 
 		 508 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  21.37 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  24.44 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  21.05 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  21.05 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  23.61 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  21.72 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  19.87 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  21.43 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>