45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2011 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  78.12 
 
 		 438 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  100 
 
 		 440 aa  904    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  39.72 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  38.59 
 
 		 452 aa  322  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  38.61 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  36.84 
 
 		 480 aa  296  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  35.84 
 
 		 469 aa  289  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  33.77 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  35.68 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  36.77 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  35.59 
 
 		 468 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  34.65 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  34.9 
 
 		 453 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  37.62 
 
 		 499 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  38.35 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  38.35 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  38.15 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  37.41 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  37.09 
 
 		 435 aa  279  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  35.86 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  35.47 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  35.52 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  32.63 
 
 		 536 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  36.41 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  36.53 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  34.82 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  33.57 
 
 		 578 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  31.28 
 
 		 538 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  33.04 
 
 		 460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  33.04 
 
 		 460 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  33.04 
 
 		 460 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  32.81 
 
 		 460 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  33.74 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  31.28 
 
 		 538 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  33.57 
 
 		 466 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  34.13 
 
 		 466 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  33.87 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  34.13 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  33.87 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  30.81 
 
 		 538 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  33.81 
 
 		 466 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  31.7 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.88 
 
 		 743 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  25.68 
 
 		 281 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  32.11 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>