More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1952 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2467  ATP-dependent protease  62.54 
 
 
580 aa  732  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00344984  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1952  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
570 aa  1176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1857  ATP-dependent protease  57.04 
 
 
577 aa  655  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2149  ATP-dependent protease  59.3 
 
 
543 aa  686  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.59451e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1638  ATP-dependent protease  55.3 
 
 
577 aa  641  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00274053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2564  ATP-dependent protease  56.17 
 
 
577 aa  648  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.55632e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1818  ATP-dependent protease  56.64 
 
 
569 aa  640  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097725  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1613  ATP-dependent protease  56.17 
 
 
582 aa  651  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.99604e-05  normal  0.391845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2679  ATP-dependent protease  56.17 
 
 
577 aa  650  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0066735  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2604  ATP-dependent protease  56 
 
 
577 aa  646  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.49813e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1780  conserved hypothetical ATP-dependent protease  55.83 
 
 
577 aa  645  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.00505e-07  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1607  ATP-dependent protease  56.17 
 
 
582 aa  650  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.44541e-07  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1546  ATP-dependent protease  56.17 
 
 
582 aa  653  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000113225  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2655  ATP-dependent protease  52.86 
 
 
596 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  52.16 
 
 
599 aa  614  1e-174  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.27268e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1606  ATP-dependent protease  52.96 
 
 
576 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.40956e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.98 
 
 
802 aa  313  8e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  37.88 
 
 
832 aa  299  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  38.09 
 
 
829 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.80038e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  37.83 
 
 
546 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.34026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  37.15 
 
 
803 aa  294  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  36.81 
 
 
546 aa  294  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1564  peptidase S16 lon domain protein  40.41 
 
 
575 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.74 
 
 
816 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  36.93 
 
 
817 aa  290  5e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  36.02 
 
 
803 aa  289  7e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  36.93 
 
 
817 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  41.4 
 
 
809 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  33.83 
 
 
800 aa  287  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.51631e-05  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  38.07 
 
 
806 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  37.76 
 
 
808 aa  284  2e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  36.52 
 
 
818 aa  285  2e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  34.47 
 
 
799 aa  285  2e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  32.99 
 
 
831 aa  285  2e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.65888e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  36.68 
 
 
827 aa  284  4e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.39 
 
 
807 aa  284  4e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  37.55 
 
 
813 aa  283  5e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  37.04 
 
 
811 aa  283  5e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  38.61 
 
 
598 aa  283  8e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  37.8 
 
 
590 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.64824e-07  decreased coverage  6.03795e-07 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  34.64 
 
 
786 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  36.82 
 
 
811 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  34.2 
 
 
786 aa  281  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.69 
 
 
805 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  39.69 
 
 
805 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  37.57 
 
 
786 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2860  hypothetical protein  39.56 
 
 
589 aa  280  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  7.2938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.43 
 
 
805 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.43 
 
 
805 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  35.08 
 
 
811 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.81 
 
 
843 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  38.93 
 
 
583 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.94909e-10  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  38.93 
 
 
583 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  36.34 
 
 
812 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  38.93 
 
 
540 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  5.10666e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.19 
 
 
813 aa  277  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1557  putative protease La homolog  38.04 
 
 
555 aa  277  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00224903  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  34.41 
 
 
861 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.97 
 
 
806 aa  277  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.48 
 
 
810 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  35.57 
 
 
798 aa  277  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2551  hypothetical protein  38.46 
 
 
589 aa  276  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000314257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  39.58 
 
 
805 aa  275  2e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  33.78 
 
 
802 aa  275  2e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.85 
 
 
865 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.58 
 
 
805 aa  273  5e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  35.16 
 
 
815 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  33.4 
 
 
798 aa  273  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  38.86 
 
 
806 aa  273  8e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  40.26 
 
 
660 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  35.51 
 
 
795 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  39.32 
 
 
805 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1598  hypothetical protein  36.12 
 
 
576 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  9.47515e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  36.4 
 
 
812 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  35.97 
 
 
812 aa  270  6e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  35.97 
 
 
812 aa  270  6e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.01 
 
 
812 aa  270  6e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  34.47 
 
 
814 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  34.42 
 
 
777 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  35.18 
 
 
784 aa  267  3e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  34.12 
 
 
795 aa  266  9e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  35.98 
 
 
813 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.01 
 
 
783 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  35.41 
 
 
791 aa  264  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  37.63 
 
 
819 aa  263  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  37.77 
 
 
803 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.49 
 
 
788 aa  262  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  32.32 
 
 
873 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.8 
 
 
801 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  32.87 
 
 
819 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  33.91 
 
 
806 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.75 
 
 
806 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  35.9 
 
 
844 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  35.76 
 
 
797 aa  257  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.98 
 
 
805 aa  257  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  35.35 
 
 
810 aa  257  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  32.46 
 
 
819 aa  256  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  32.14 
 
 
814 aa  256  1e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.97 
 
 
815 aa  254  4e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.7 
 
 
805 aa  254  4e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>