83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1838 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1838  multidrug resistance efflux pump-like protein  100 
 
 		 363 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000704068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2739  multidrug resistance efflux pump-like protein  64.16 
 
 		 343 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1900  multidrug resistance efflux pump-like protein  62.24 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1469  multidrug resistance efflux pump-like protein  56.01 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1470  membrane-fusion protein  25.67 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1901  secretion protein HlyD family protein  24.8 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2738  membrane-fusion protein  28.4 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1839  membrane-fusion protein  25.93 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00691456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7080  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  26.67 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.33 
 
 		 607 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.67 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.67 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  26.67 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.67 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  26.67 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  26.22 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  25.95 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  23.74 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.61 
 
 		 415 aa  52.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  27.98 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  24.52 
 
 		 410 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 450 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  26.81 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  34.07 
 
 		 477 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 415 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.4 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  26.64 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 402 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  26.05 
 
 		 335 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.05 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  24.41 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  25.34 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  22.99 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  22.18 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  24.14 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  30.46 
 
 		 621 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  27.72 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 598 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.48 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 417 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03081  ABC transporter ATP-binding protein  26.54 
 
 		 417 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.955285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.63 
 
 		 504 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  26.74 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  28.26 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  28.8 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  25.09 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  24.52 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  25.62 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  25.19 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  22.71 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  26.26 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  24.22 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  22.01 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  24.9 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4025  secretion protein HlyD family protein  24.59 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21240  multidrug resistance efflux pump  23.47 
 
 		 536 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  24.9 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  24.9 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  24.9 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  24.9 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  31.01 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  23.14 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  24.89 
 
 		 461 aa  43.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  24.9 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  23.08 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  23.08 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  23.08 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  23.08 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  26.9 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  28.81 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>