279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1732 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  831    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  50.52 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  42.09 
 
 		 414 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  41.6 
 
 		 408 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  41.6 
 
 		 408 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  40.51 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  40.76 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  44.42 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  41.6 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  40.76 
 
 		 411 aa  326  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  40.51 
 
 		 411 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  40.76 
 
 		 411 aa  325  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  40.51 
 
 		 411 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  40.25 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  43.19 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  40.25 
 
 		 411 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  40.25 
 
 		 411 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  41.31 
 
 		 447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  43.48 
 
 		 395 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  41.49 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  41.43 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  41.49 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  41.49 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.16 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.16 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  41.49 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.16 
 
 		 398 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.16 
 
 		 398 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.97 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.16 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.86 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  42.86 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  39.17 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  40.55 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  40.66 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  41.52 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  40.05 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  39.54 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  39.46 
 
 		 440 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  39.19 
 
 		 405 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  40.4 
 
 		 414 aa  295  8e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  40.05 
 
 		 381 aa  295  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  37 
 
 		 444 aa  293  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  37.5 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  37.5 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  37.23 
 
 		 394 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  36.97 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  37.34 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  37.08 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  37.08 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  35.68 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  35.68 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  34.7 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  33.6 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 367 aa  215  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  35.36 
 
 		 280 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1761  radical SAM domain protein  33.82 
 
 		 214 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  23.17 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  25.3 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  21.8 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  21.61 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  22.99 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  22.22 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  22.99 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 439 aa  90.5  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  21.23 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 815 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  25.2 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>