More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1711 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  100 
 
 
434 aa  911    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  67.89 
 
 
461 aa  633  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  68.21 
 
 
439 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  68.58 
 
 
441 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  60.28 
 
 
441 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  46.54 
 
 
436 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  41.91 
 
 
443 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  44.95 
 
 
444 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  43.12 
 
 
444 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  43.12 
 
 
444 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  43.12 
 
 
444 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  43.59 
 
 
444 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  42.89 
 
 
444 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  44.44 
 
 
437 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  43.12 
 
 
444 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  41.47 
 
 
443 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  42.27 
 
 
454 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  43.35 
 
 
444 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  43.12 
 
 
444 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  43.12 
 
 
444 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  42.33 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  41.15 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  42.07 
 
 
436 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  44.24 
 
 
439 aa  348  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  41.26 
 
 
446 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  41.26 
 
 
446 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  41.65 
 
 
461 aa  346  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  40.55 
 
 
439 aa  345  8e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  43.59 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  42.86 
 
 
439 aa  343  4e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  42.53 
 
 
439 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  40.37 
 
 
454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  42.3 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  42.3 
 
 
439 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  39.77 
 
 
438 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  39.77 
 
 
438 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  40.46 
 
 
437 aa  334  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  40.32 
 
 
437 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  40.32 
 
 
437 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  40.32 
 
 
437 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  39.73 
 
 
441 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  39.54 
 
 
438 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  39.54 
 
 
438 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  39.54 
 
 
438 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  39.54 
 
 
441 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  39.54 
 
 
441 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  39.77 
 
 
441 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  39.54 
 
 
441 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  39.54 
 
 
441 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  40.6 
 
 
439 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  41.86 
 
 
436 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  43.25 
 
 
442 aa  330  4e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  42.56 
 
 
449 aa  329  6e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  39.77 
 
 
437 aa  328  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  39.31 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  39.31 
 
 
441 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  39.31 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  43.48 
 
 
442 aa  326  6e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  40.69 
 
 
440 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  40.18 
 
 
436 aa  323  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  40.14 
 
 
433 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  39.37 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  41.3 
 
 
441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  40.72 
 
 
465 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  39.86 
 
 
442 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  41.31 
 
 
474 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  38.83 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  38.16 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  39.17 
 
 
452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  38.07 
 
 
441 aa  312  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  38.96 
 
 
435 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  43.54 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  41.8 
 
 
446 aa  309  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  38.94 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  37.82 
 
 
439 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  38.12 
 
 
458 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3277  peptidase M24  41.34 
 
 
442 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.609187  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  37.59 
 
 
439 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  39.34 
 
 
447 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  41.56 
 
 
426 aa  300  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  39.86 
 
 
437 aa  299  6e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  37.24 
 
 
439 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  37.53 
 
 
462 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  37.56 
 
 
459 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  36.59 
 
 
464 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  36.59 
 
 
464 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15611  putative aminopeptidase P  39.01 
 
 
439 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  36.44 
 
 
461 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  37.28 
 
 
514 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  37.39 
 
 
435 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  38.91 
 
 
439 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  37.17 
 
 
461 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  39 
 
 
441 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  37.28 
 
 
499 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  38.18 
 
 
441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  38.06 
 
 
437 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  37.22 
 
 
458 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  38.24 
 
 
439 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16321  putative aminopeptidase P  37.61 
 
 
441 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16441  putative aminopeptidase P  38.06 
 
 
441 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.689084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>