100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1708 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  80.35 
 
 		 509 aa  879    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1072    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.718334  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  33.27 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  33.27 
 
 		 511 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 520 aa  269  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  32.09 
 
 		 522 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.68 
 
 		 562 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  23.7 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.3 
 
 		 544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  21.4 
 
 		 547 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  25.05 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  23.71 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 		 534 aa  91.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  23.46 
 
 		 711 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  21.18 
 
 		 495 aa  87.4  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  23.45 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 		 722 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  21.74 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.09 
 
 		 740 aa  83.6  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  22.52 
 
 		 708 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 		 717 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.62 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.06 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  22.82 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  22.79 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.41 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  23.62 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  22.57 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  22.29 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.12 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  22.88 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  22.88 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  21.02 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.48 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  19.16 
 
 		 923 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  21.46 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  21.81 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  22.12 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  21.9 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  19.46 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  22.85 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  22.4 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  20.83 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  22.41 
 
 		 510 aa  67  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  21.66 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  19.43 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  22.54 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  20.49 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  21.74 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.54 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  20.57 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  22.09 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  21.97 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  19.88 
 
 		 938 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  22.13 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  22.94 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  21.75 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  21.38 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  21.55 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  20.51 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  21.98 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  21.79 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  22.29 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  21.29 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  23.98 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  23.19 
 
 		 530 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  20.43 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 547 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  21.03 
 
 		 553 aa  53.5  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  20 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  18.88 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  20.58 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  19.82 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  22.12 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  22.04 
 
 		 556 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  20.99 
 
 		 510 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  22.43 
 
 		 512 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  48.84 
 
 		 598 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  20.54 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  20.76 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  18.36 
 
 		 523 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  22.34 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  22.83 
 
 		 645 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  22.54 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  21.54 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  20.78 
 
 		 516 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  21.09 
 
 		 521 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  20.15 
 
 		 556 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  22.74 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  19.1 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  25 
 
 		 494 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  39.62 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>