252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1476 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  58.75 
 
 
303 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  54.79 
 
 
303 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  54.46 
 
 
303 aa  331  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  51.14 
 
 
307 aa  325  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  55.12 
 
 
303 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  52.32 
 
 
303 aa  316  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  51.82 
 
 
303 aa  316  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  55.12 
 
 
303 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  54.79 
 
 
303 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  54.46 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  53.47 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  52.48 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  53.8 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  53.47 
 
 
303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  52.81 
 
 
303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.85 
 
 
462 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  35.36 
 
 
306 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.97 
 
 
479 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  34.29 
 
 
312 aa  168  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  34.8 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  35.09 
 
 
468 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  34.04 
 
 
313 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.21 
 
 
489 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  36.36 
 
 
464 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.36 
 
 
462 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  36.23 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  31.68 
 
 
462 aa  141  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.59 
 
 
476 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.81 
 
 
528 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.98 
 
 
464 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  35.85 
 
 
465 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  35.61 
 
 
464 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.97 
 
 
487 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.75 
 
 
482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.85 
 
 
464 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.53 
 
 
554 aa  135  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  31.94 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  33.22 
 
 
459 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  35.23 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.97 
 
 
480 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.6 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.72 
 
 
502 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.51 
 
 
493 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  41.07 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  33.83 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  33.83 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  31.58 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.83 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.84 
 
 
473 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  31.06 
 
 
457 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  31.06 
 
 
459 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  32.58 
 
 
474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  30.68 
 
 
457 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.82 
 
 
473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  31.06 
 
 
457 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.83 
 
 
472 aa  126  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  31.09 
 
 
457 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  32.21 
 
 
473 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  31.09 
 
 
457 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  32.21 
 
 
473 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  31.09 
 
 
457 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  31.09 
 
 
457 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.09 
 
 
457 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  31.09 
 
 
457 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  31.09 
 
 
457 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  31.09 
 
 
457 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  31.09 
 
 
457 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  32.96 
 
 
467 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.34 
 
 
467 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  30.94 
 
 
472 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.37 
 
 
473 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  32.58 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  30.68 
 
 
457 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.7 
 
 
461 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  30.98 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.34 
 
 
463 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.34 
 
 
464 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.34 
 
 
463 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  32.2 
 
 
212 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.25 
 
 
481 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.96 
 
 
463 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.68 
 
 
478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.75 
 
 
495 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.91 
 
 
476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.68 
 
 
478 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.37 
 
 
484 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.15 
 
 
478 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.58 
 
 
482 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.62 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31 
 
 
480 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.48 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  37.13 
 
 
246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  34.66 
 
 
214 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  28.24 
 
 
480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  32.4 
 
 
225 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  28.41 
 
 
485 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.7 
 
 
458 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.51 
 
 
478 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.45 
 
 
479 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>