More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1418 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  80.15 
 
 		 388 aa  648    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  789    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  80.15 
 
 		 388 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  80.15 
 
 		 388 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  80.41 
 
 		 397 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  78.61 
 
 		 388 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  77.26 
 
 		 391 aa  628  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.8 
 
 		 388 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.03 
 
 		 388 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  75.97 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  76.03 
 
 		 388 aa  617  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75 
 
 		 388 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  74.62 
 
 		 390 aa  615  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  75.77 
 
 		 389 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  75.26 
 
 		 388 aa  614  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.48 
 
 		 389 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  611  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.26 
 
 		 388 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.48 
 
 		 388 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  74.48 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  74.48 
 
 		 388 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.74 
 
 		 388 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.23 
 
 		 388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.71 
 
 		 387 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 387 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.71 
 
 		 387 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.68 
 
 		 389 aa  594  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.45 
 
 		 387 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  72.94 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  72.68 
 
 		 388 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  72.94 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  71.39 
 
 		 389 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  72.94 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  71.39 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  71.13 
 
 		 409 aa  587  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.42 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.16 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  71.65 
 
 		 388 aa  585  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  71.13 
 
 		 409 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  71.13 
 
 		 409 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.62 
 
 		 387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  69.85 
 
 		 388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  67.53 
 
 		 388 aa  557  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.72 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.77 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.7 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  62.05 
 
 		 389 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  60.54 
 
 		 491 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  58.69 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.28 
 
 		 388 aa  471  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.84 
 
 		 372 aa  435  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  55.19 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  50.9 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  50.9 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.9 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.87 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  31.42 
 
 		 447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  33.24 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.5 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  30 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.68 
 
 		 451 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  31.84 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.01 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  32.24 
 
 		 443 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  30.57 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.01 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  32.5 
 
 		 457 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.87 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  32.96 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.96 
 
 		 441 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.43 
 
 		 457 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.61 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.74 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  29.44 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.2 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  30.17 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  30.75 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  30.17 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.7 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.77 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  28.8 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  32.39 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  30.73 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  31.04 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  30.19 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.12 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.54 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.35 
 
 		 439 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  31.48 
 
 		 473 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.78 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.65 
 
 		 456 aa  163  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  30.08 
 
 		 446 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  31.36 
 
 		 437 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  31.36 
 
 		 437 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.65 
 
 		 478 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  31.74 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>