78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1404 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 990 aa  2036    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  39.04 
 
 		 1022 aa  691    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  37.01 
 
 		 779 aa  465  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  36.15 
 
 		 771 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  36.6 
 
 		 779 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  36.03 
 
 		 774 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  35.86 
 
 		 795 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  34.26 
 
 		 815 aa  430  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  34.03 
 
 		 814 aa  429  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  34.9 
 
 		 693 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  34.31 
 
 		 754 aa  399  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7106  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  34.83 
 
 		 414 aa  211  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0729  phosphoenolpyruvate synthase-related protein  35.54 
 
 		 396 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7108  hypothetical protein  32.58 
 
 		 358 aa  189  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0728  hypothetical protein  29.31 
 
 		 389 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  27.9 
 
 		 890 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.85 
 
 		 867 aa  65.1  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  27.7 
 
 		 868 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  23.58 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  29.15 
 
 		 869 aa  61.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  27.32 
 
 		 907 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.15 
 
 		 811 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  29.38 
 
 		 868 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  28.87 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  29.38 
 
 		 868 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.65 
 
 		 903 aa  60.1  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.18 
 
 		 821 aa  59.3  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  28.87 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  27.46 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  27.21 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  29.47 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  39.29 
 
 		 971 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  27.15 
 
 		 869 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.91 
 
 		 887 aa  57  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.17 
 
 		 797 aa  56.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  24.92 
 
 		 1240 aa  55.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.27 
 
 		 959 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 868 aa  55.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 		 868 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  25.9 
 
 		 870 aa  54.7  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  27 
 
 		 791 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.29 
 
 		 950 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 891 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.46 
 
 		 889 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.55 
 
 		 887 aa  53.5  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.47 
 
 		 873 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  21.43 
 
 		 852 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  28.97 
 
 		 866 aa  52.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  30.61 
 
 		 865 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  22.95 
 
 		 249 aa  52  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1774  pyruvate, water dikinase  46 
 
 		 780 aa  50.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.34 
 
 		 868 aa  50.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  30.08 
 
 		 790 aa  50.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  22.81 
 
 		 906 aa  50.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.71 
 
 		 692 aa  50.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  24.1 
 
 		 837 aa  49.7  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  31.29 
 
 		 871 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  25.26 
 
 		 253 aa  49.3  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  27.06 
 
 		 788 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.13 
 
 		 869 aa  49.3  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.98 
 
 		 830 aa  48.9  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  26.83 
 
 		 789 aa  48.5  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  37.8 
 
 		 794 aa  48.1  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  32.58 
 
 		 886 aa  48.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  39.19 
 
 		 386 aa  47.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  35.23 
 
 		 805 aa  47.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  28.46 
 
 		 789 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  21.22 
 
 		 263 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  38.16 
 
 		 956 aa  47.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  33.02 
 
 		 708 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.7 
 
 		 975 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  33.02 
 
 		 725 aa  45.8  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  28.57 
 
 		 1097 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  39.44 
 
 		 963 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  40.38 
 
 		 793 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  30.21 
 
 		 911 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3388  phosphoenolpyruvate synthase  40.74 
 
 		 775 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  26.56 
 
 		 795 aa  44.7  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>