220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1368 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
342 aa  698    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  88.63 
 
 
343 aa  630  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  88.63 
 
 
343 aa  630  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  87.9 
 
 
343 aa  628  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  88.34 
 
 
343 aa  629  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  88.3 
 
 
341 aa  628  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  90.35 
 
 
341 aa  620  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  88.6 
 
 
342 aa  617  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  88.6 
 
 
342 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  88.6 
 
 
342 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  88.63 
 
 
343 aa  614  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  87.43 
 
 
342 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  88.3 
 
 
342 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  87.57 
 
 
342 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  87.13 
 
 
342 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  78.34 
 
 
352 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  75.22 
 
 
354 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  76.56 
 
 
352 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  74.17 
 
 
348 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  73.49 
 
 
348 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  71.39 
 
 
349 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  73.49 
 
 
343 aa  506  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  63.55 
 
 
322 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  62.54 
 
 
326 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  62.19 
 
 
322 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  62.11 
 
 
322 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  62.19 
 
 
322 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  62.19 
 
 
322 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  61.37 
 
 
322 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  60.62 
 
 
322 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  63.75 
 
 
323 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  63.75 
 
 
323 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  59.53 
 
 
333 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  63.04 
 
 
323 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  58.49 
 
 
324 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  60 
 
 
332 aa  401  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  62.54 
 
 
324 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  60.56 
 
 
395 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  55.94 
 
 
334 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  54.66 
 
 
337 aa  381  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  57.59 
 
 
381 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  54.66 
 
 
337 aa  381  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  48.46 
 
 
336 aa  352  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  51.72 
 
 
347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  47.42 
 
 
338 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  47.13 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  46.35 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  44.27 
 
 
332 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  45.51 
 
 
335 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  45.51 
 
 
335 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1331  flagellar motor switch protein FliM  94.29 
 
 
190 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 
332 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
332 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  43.83 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  43.83 
 
 
332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  43.95 
 
 
336 aa  302  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  43.52 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  43.52 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  43.52 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  43.83 
 
 
332 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  41.99 
 
 
335 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  43.21 
 
 
332 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  43.52 
 
 
332 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1333  surface presentation of antigens (SPOA) protein  81.87 
 
 
181 aa  298  8e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 
332 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 
332 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 
332 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
332 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  43.59 
 
 
326 aa  295  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
332 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
332 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
332 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  43.53 
 
 
333 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  44.3 
 
 
336 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  42.41 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  40.26 
 
 
329 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  42.32 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  39.63 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  43.17 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  39.94 
 
 
333 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  39.1 
 
 
334 aa  272  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  40.51 
 
 
334 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  40.51 
 
 
334 aa  271  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  39.25 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  39.94 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  40.38 
 
 
334 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  39.94 
 
 
334 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  39.94 
 
 
334 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  39.94 
 
 
334 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  39.94 
 
 
334 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  39.94 
 
 
334 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  38.85 
 
 
337 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  39.62 
 
 
334 aa  259  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  39.1 
 
 
333 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  39.1 
 
 
333 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  39.17 
 
 
337 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
334 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
334 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
334 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  38.98 
 
 
334 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>