More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1358 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 371 aa  758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  72.08 
 
 		 370 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.79 
 
 		 360 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.79 
 
 		 360 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.79 
 
 		 360 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.79 
 
 		 360 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  72.59 
 
 		 362 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  69.8 
 
 		 360 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3069  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.23 
 
 		 371 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  70.24 
 
 		 356 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1321  ATP-binding region, ATPase-like protein  70.21 
 
 		 356 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1279  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  70.37 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  70.66 
 
 		 360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  70.09 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.400038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3231  flagellar regulatory protein B  69.23 
 
 		 360 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2300  flagellar regulatory protein B  65.73 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2311  histidine kinase  48.3 
 
 		 347 aa  301  9e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1720  flagellar regulatory protein B  46.33 
 
 		 351 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00341718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02892  putative sensory box sensor histidine kinase in two-component regulatory system  49.54 
 
 		 380 aa  298  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3050  histidine kinase  47.6 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2000  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 411 aa  296  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  43.95 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1499  flagellar regulatory protein B  44.72 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002812  flagellar sensor histidine kinase FleS  47.09 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03165  hypothetical protein  46.67 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3697  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 405 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3933  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1495  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50200  two-component sensor  44.15 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3460  flagellar sensor histidine kinase FleS  41.98 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1955  sensor histidine kinase FleS  42.81 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2828  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.453157  normal  0.0182492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2192  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1727  hypothetical protein  37.97 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1727  hypothetical protein  37.66 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  32.74 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 564 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 581 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0799101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.59 
 
 		 579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 722 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.9 
 
 		 679 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.71 
 
 		 604 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 595 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  31.98 
 
 		 604 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0852  histidine kinase  29.87 
 
 		 528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.152084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  27.81 
 
 		 608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.81 
 
 		 608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  27.81 
 
 		 608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  27.81 
 
 		 608 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  27.81 
 
 		 608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  27.81 
 
 		 608 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 832 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 480 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.9 
 
 		 519 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  29.21 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  31.49 
 
 		 458 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2391  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 573 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000390402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 673 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 		 929 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  30.87 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 680 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  31.06 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.6 
 
 		 616 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  31.06 
 
 		 465 aa  106  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  30.64 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  30.64 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.98 
 
 		 598 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  24.1 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.09 
 
 		 1215 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  31.06 
 
 		 458 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 546 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 447 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 631 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 571 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  28.4 
 
 		 612 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  25.29 
 
 		 613 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  30.64 
 
 		 458 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  33.95 
 
 		 484 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  27.54 
 
 		 611 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  26.27 
 
 		 830 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 497 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1253  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.22 
 
 		 638 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228716  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  26.96 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.03 
 
 		 539 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 736 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>