More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1330 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1330  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
417 aa  803    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05172  glutamate-aspartate symport protein  68.18 
 
 
435 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  38.62 
 
 
422 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  38.21 
 
 
419 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  37.43 
 
 
413 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  36.58 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  34.56 
 
 
436 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33 
 
 
436 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  33.94 
 
 
437 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  34.52 
 
 
442 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  36.61 
 
 
444 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  36.34 
 
 
444 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  36.61 
 
 
444 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  36.61 
 
 
444 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  35.91 
 
 
435 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  35.62 
 
 
440 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  35.62 
 
 
440 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  32.47 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  33.97 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  32.47 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  33.08 
 
 
411 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  35.07 
 
 
443 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  35.62 
 
 
424 aa  200  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  33.24 
 
 
440 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  32.97 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.51 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  35.52 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  32.97 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  32.97 
 
 
440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  33.24 
 
 
449 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  34.27 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  35.91 
 
 
430 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  32.57 
 
 
411 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  32.57 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.57 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.57 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  32.57 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  32.57 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  34.53 
 
 
432 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  35.73 
 
 
433 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  32.57 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  34.44 
 
 
449 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.43 
 
 
434 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  32.32 
 
 
411 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  32.06 
 
 
411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  32.19 
 
 
445 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  32.32 
 
 
411 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  33.06 
 
 
433 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  34.15 
 
 
447 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  32.21 
 
 
434 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  33.67 
 
 
409 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  33.77 
 
 
434 aa  186  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  32.43 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  33.49 
 
 
425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  32.14 
 
 
410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  35.5 
 
 
405 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  33.68 
 
 
444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  36.1 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  33.42 
 
 
444 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  34.89 
 
 
413 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  33.67 
 
 
479 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  34.13 
 
 
441 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 
424 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  34.99 
 
 
425 aa  180  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  34.69 
 
 
417 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  32.53 
 
 
416 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  34.05 
 
 
409 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  32.53 
 
 
416 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  32.53 
 
 
416 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  32.71 
 
 
409 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  34.42 
 
 
441 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  33.6 
 
 
438 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  32.53 
 
 
416 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  32.91 
 
 
427 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  33.78 
 
 
409 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  32.89 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  32.88 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  32.16 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  31.62 
 
 
443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  32.07 
 
 
438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  34.05 
 
 
408 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  34.36 
 
 
441 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  32.27 
 
 
408 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  30.83 
 
 
425 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 
437 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  34.24 
 
 
419 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  34.79 
 
 
424 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  34.79 
 
 
424 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  36.01 
 
 
420 aa  170  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  32.89 
 
 
438 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  31.7 
 
 
443 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  32.07 
 
 
438 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  33.97 
 
 
419 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  30.34 
 
 
457 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  32.36 
 
 
443 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  32.89 
 
 
408 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  30.29 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  30.2 
 
 
437 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  31.01 
 
 
409 aa  167  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  33.6 
 
 
420 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>