More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1300 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  62.02 
 
 
581 aa  751    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  62.91 
 
 
581 aa  766    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  60.76 
 
 
583 aa  734    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  61.95 
 
 
581 aa  742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  100 
 
 
592 aa  1224    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  62.43 
 
 
577 aa  753    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  58.62 
 
 
580 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  61.57 
 
 
583 aa  743    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  61.74 
 
 
583 aa  747    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  59.1 
 
 
578 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  62.09 
 
 
583 aa  748    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  57.57 
 
 
573 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  62.37 
 
 
581 aa  756    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  62.2 
 
 
581 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  64.77 
 
 
586 aa  772    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  62.2 
 
 
580 aa  755    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  44.39 
 
 
580 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  42.47 
 
 
585 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  41.62 
 
 
578 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  39.39 
 
 
579 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  32.56 
 
 
664 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  29.57 
 
 
526 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  28.64 
 
 
663 aa  214  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.24 
 
 
591 aa  213  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  26.91 
 
 
607 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.75 
 
 
663 aa  210  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.78 
 
 
523 aa  210  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.96 
 
 
523 aa  210  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  29.14 
 
 
529 aa  209  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  30.07 
 
 
584 aa  208  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.72 
 
 
601 aa  207  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.33 
 
 
533 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.69 
 
 
555 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.8 
 
 
627 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  30.07 
 
 
581 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  28.6 
 
 
625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  26.4 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.09 
 
 
638 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  28.42 
 
 
532 aa  195  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  27.36 
 
 
637 aa  194  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.85 
 
 
607 aa  194  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  27.56 
 
 
637 aa  191  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.24 
 
 
659 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.5 
 
 
657 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.88 
 
 
605 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.81 
 
 
672 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  26.25 
 
 
641 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 
582 aa  179  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.24 
 
 
587 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  26.44 
 
 
520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  24.82 
 
 
619 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.5 
 
 
508 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25.8 
 
 
504 aa  134  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.07 
 
 
523 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  23.58 
 
 
515 aa  118  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.86 
 
 
509 aa  117  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.86 
 
 
1202 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.86 
 
 
1215 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  22.3 
 
 
530 aa  110  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.06 
 
 
515 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.48 
 
 
517 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.37 
 
 
1181 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.65 
 
 
516 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  24.14 
 
 
512 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.94 
 
 
1175 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.18 
 
 
508 aa  101  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.18 
 
 
508 aa  101  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.04 
 
 
503 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  23.4 
 
 
520 aa  98.6  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
302 aa  97.1  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.2 
 
 
1284 aa  95.1  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  24.26 
 
 
508 aa  93.2  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  28.22 
 
 
481 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.05 
 
 
491 aa  90.9  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  20.94 
 
 
523 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  32.8 
 
 
315 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  20.74 
 
 
520 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  20.74 
 
 
520 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  22.99 
 
 
489 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  20.74 
 
 
523 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  23.3 
 
 
504 aa  88.6  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.28 
 
 
722 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  27.48 
 
 
313 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  22.16 
 
 
533 aa  87.8  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  21.48 
 
 
772 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  21.48 
 
 
772 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.1 
 
 
549 aa  84.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
313 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2912  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
463 aa  84  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  20.14 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.86 
 
 
549 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.48 
 
 
530 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.28 
 
 
479 aa  82  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  20.07 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  20.07 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  20.07 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  20.07 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  20.07 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  20.38 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  20.23 
 
 
529 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>