138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1133 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  87.16 
 
 		 109 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  84.4 
 
 		 109 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  86.24 
 
 		 109 aa  187  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  81.65 
 
 		 121 aa  185  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  76.85 
 
 		 109 aa  173  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  77.98 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  77.98 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  77.98 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  77.98 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  77.06 
 
 		 109 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000428708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  77.06 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  77.06 
 
 		 109 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  77.06 
 
 		 109 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  77.06 
 
 		 109 aa  166  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2471  translation initiation factor Sui1  72.48 
 
 		 109 aa  154  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  59.62 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1163  translation initiation factor SUI1  60.58 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0953729  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  60.19 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  58.25 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  59.22 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  56.36 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  55.96 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  54.9 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  54.13 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  56.07 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  54.13 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  56.07 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  56.07 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  56.07 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  56.07 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  56.07 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  54.21 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  54.21 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  54.21 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  54.21 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  54.21 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  54.21 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  54.21 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  53.21 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  53.77 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  54.21 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  52.83 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  52.34 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  52.34 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  52.34 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  52.94 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0513  translation initiation factor Sui1  57.41 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.435578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  49.09 
 
 		 119 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  47.75 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  47.75 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  46.15 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  49.12 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  49.59 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0321  translation initiation factor SUI1  50.41 
 
 		 124 aa  95.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  45.08 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  47.37 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  49.11 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  42.5 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  45.61 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  46.85 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  42.74 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  42.74 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  44.07 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  43.09 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  40.68 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  45.95 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  42.48 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3689  putative translation initation factor SUI1  54.9 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  44.14 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  45.95 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  42.73 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  44.14 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  41.82 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  42.73 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  42.73 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  42.73 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  50 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  41.82 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07040  translation initiation factor Sui1  42.34 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  40.19 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  39.42 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  39.09 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  46.05 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  46.05 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4512  translation initiation factor SUI1  40 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  41.76 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1627  translation initiation factor SUI1  40.48 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  40.66 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  44.44 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  35.14 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2099  putative translation initiation factor SUI1  43.9 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  40.54 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  35.79 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  33.65 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  36.96 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  38.04 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1532  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.04 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02391  translation initiation factor SUI1  38.04 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  43.94 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>