More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1075 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  754    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  74.11 
 
 		 367 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  68.66 
 
 		 367 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  66.85 
 
 		 368 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  64.78 
 
 		 376 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  60.59 
 
 		 377 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  59.62 
 
 		 373 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  59.3 
 
 		 369 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  57.37 
 
 		 372 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  58.18 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  58.22 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  58.92 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  57.1 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  57.22 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  58.22 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  58.22 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  30.41 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  30.35 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  41.59 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.81 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.81 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  29.68 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.77 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.32 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.67 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.57 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.11 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.11 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  35.53 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.11 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  33.33 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  30.03 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  44.37 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.29 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  32.4 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  27.63 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  36.41 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  41.89 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.45 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  37.89 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  34.88 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.41 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  35.37 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  30.24 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.86 
 
 		 447 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.39 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  40.27 
 
 		 201 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  35.14 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  27.33 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  35.03 
 
 		 200 aa  113  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  24.93 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  27.4 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.17 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.47 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  33.93 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  26.16 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  30.66 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  27.22 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  32.24 
 
 		 209 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 210 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  31.87 
 
 		 212 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.48 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  25.91 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  35.22 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  34.9 
 
 		 204 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  42.2 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 		 202 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  35.14 
 
 		 204 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 		 202 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  33.12 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  34.9 
 
 		 201 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 201 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 		 202 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 		 185 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 		 202 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  32.21 
 
 		 208 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  25.38 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 		 202 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  24.85 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  30.28 
 
 		 454 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  29.3 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  26.23 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  33.95 
 
 		 218 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  26.2 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 		 202 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 		 202 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  25.93 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  26.18 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 237 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  25.36 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.55 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.44 
 
 		 623 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 543 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  34.42 
 
 		 510 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  31.61 
 
 		 201 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  29.88 
 
 		 201 aa  92.8  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.19 
 
 		 544 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>