27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0926 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  904    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  29.78 
 
 
1281 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.11 
 
 
752 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  30.68 
 
 
575 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  29.23 
 
 
572 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  30.23 
 
 
799 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  28.57 
 
 
892 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  29.75 
 
 
1316 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  31.1 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  29.93 
 
 
1180 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  30.43 
 
 
575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  31.98 
 
 
526 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  27.57 
 
 
905 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  23.9 
 
 
1361 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.9 
 
 
1776 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  23.01 
 
 
657 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  25.87 
 
 
1279 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  38.82 
 
 
932 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  24.24 
 
 
316 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  34.52 
 
 
490 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  26.67 
 
 
201 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  22.93 
 
 
649 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 
490 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  35 
 
 
683 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  34.72 
 
 
924 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  30.77 
 
 
536 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  26.32 
 
 
1245 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>