28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0925 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  100 
 
 
466 aa  935    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  34.67 
 
 
1281 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  31.44 
 
 
892 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  32.83 
 
 
572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  30.71 
 
 
905 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.01 
 
 
752 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  30.2 
 
 
799 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  31.1 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  31.8 
 
 
575 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  29.82 
 
 
1316 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  32.11 
 
 
575 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  29.27 
 
 
526 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  33.69 
 
 
316 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  29.72 
 
 
1180 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  24.48 
 
 
649 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  27.42 
 
 
1279 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  26.15 
 
 
1361 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.5 
 
 
1776 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  22.76 
 
 
657 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  28.29 
 
 
201 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  33.8 
 
 
1245 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  20.37 
 
 
4630 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  30.85 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  42.65 
 
 
932 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  35.71 
 
 
754 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  23.64 
 
 
1300 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  29.79 
 
 
490 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  29.49 
 
 
536 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>