252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0911 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  84.82 
 
 
370 aa  653  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.71858e-07  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
371 aa  749  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.66343e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  80.49 
 
 
370 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  79.4 
 
 
369 aa  617  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  81.08 
 
 
370 aa  618  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  78.05 
 
 
370 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.6572e-06  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  78.05 
 
 
370 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.74217e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  78.05 
 
 
370 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.53775e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  78.32 
 
 
370 aa  603  1e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.10304e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  77.51 
 
 
370 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  78.32 
 
 
370 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  78.59 
 
 
370 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  78.59 
 
 
370 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  77.78 
 
 
370 aa  574  1e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.09785e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  77.66 
 
 
370 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  76.02 
 
 
370 aa  566  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  5.06114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  50.41 
 
 
368 aa  355  8e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  49.58 
 
 
366 aa  352  8e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  48.17 
 
 
388 aa  339  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  40.33 
 
 
366 aa  302  6e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.55201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  42 
 
 
370 aa  299  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  41.5 
 
 
366 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  41.72 
 
 
366 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.32404e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  39.66 
 
 
358 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  37.71 
 
 
367 aa  255  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  38.51 
 
 
370 aa  242  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  38.02 
 
 
373 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  35.62 
 
 
375 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  36.64 
 
 
372 aa  236  5e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  38.07 
 
 
371 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  35.71 
 
 
375 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  36.66 
 
 
371 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  36.66 
 
 
371 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 
383 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 
371 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  34.99 
 
 
386 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  36.09 
 
 
372 aa  215  1e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  35.68 
 
 
367 aa  214  2e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  31.48 
 
 
359 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  36.9 
 
 
372 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  4.18027e-06 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  31.46 
 
 
359 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  36.55 
 
 
372 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  36.68 
 
 
364 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  9.83322e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  36.68 
 
 
364 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.28546e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  36.68 
 
 
364 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.32318e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  36.15 
 
 
376 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  37.54 
 
 
364 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.98554e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  32.18 
 
 
360 aa  198  1e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  37.25 
 
 
366 aa  196  5e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  2.45131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  37.25 
 
 
366 aa  196  5e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.20962e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  37.25 
 
 
366 aa  196  5e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.134e-09  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  37.25 
 
 
366 aa  196  5e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  9.98605e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  37.25 
 
 
366 aa  196  5e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  2.67736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  37.25 
 
 
366 aa  196  5e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.24635e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  37.25 
 
 
366 aa  196  5e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.94674e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  36.71 
 
 
366 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.85303e-05  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  36.71 
 
 
366 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  36.71 
 
 
366 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  36.71 
 
 
366 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  9.73807e-05  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  36.71 
 
 
366 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.34787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  35.34 
 
 
366 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3719  permease YjgP/YjgQ family protein  37.64 
 
 
370 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3556  permease YjgP/YjgQ family protein  36.96 
 
 
366 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  31.47 
 
 
381 aa  183  4e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3736  permease YjgP/YjgQ family protein  36.26 
 
 
359 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  34.23 
 
 
372 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  31.09 
 
 
367 aa  173  3e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  30.75 
 
 
369 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  28.02 
 
 
371 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  30.41 
 
 
361 aa  163  5e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  36.23 
 
 
370 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  31.69 
 
 
339 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 
371 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  29.05 
 
 
371 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  30.73 
 
 
371 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  32.37 
 
 
386 aa  154  3e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0875  hypothetical membrane spanning protein  35.33 
 
 
372 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  29.75 
 
 
372 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  29.75 
 
 
372 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  29.33 
 
 
365 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 
364 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  28.77 
 
 
372 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  29.12 
 
 
360 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  30.06 
 
 
359 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  29.16 
 
 
365 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  29.16 
 
 
365 aa  142  1e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  29.16 
 
 
365 aa  142  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  29.16 
 
 
365 aa  142  1e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  29.16 
 
 
365 aa  142  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  29.16 
 
 
365 aa  142  1e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  29.16 
 
 
365 aa  142  1e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  28.42 
 
 
363 aa  141  2e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  28.69 
 
 
363 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  28.35 
 
 
364 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  28.35 
 
 
364 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  28.35 
 
 
364 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  27.23 
 
 
372 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  27.81 
 
 
365 aa  137  3e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  26.81 
 
 
365 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  27.73 
 
 
373 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>