60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0906 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  34.06 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  30.54 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  34.32 
 
 
180 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  30.86 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  32.76 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  32.76 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  32.76 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  32.76 
 
 
184 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  32.16 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  31.64 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  31.25 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  30.68 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  29.08 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  31.21 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  28.98 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  26.58 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  29.89 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  28.67 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  29.45 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  31.94 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  29.65 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  35.61 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  32.12 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.37 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  28.74 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  28.66 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  29.8 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  32.14 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  28.17 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  25.35 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  29.63 
 
 
358 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  29.86 
 
 
190 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  26.47 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  28.15 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  32.35 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  25.79 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.26 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  30.09 
 
 
154 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  25.76 
 
 
133 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  22.6 
 
 
144 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  28 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  26.24 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  28 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  28 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  37.31 
 
 
150 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  26.36 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  27.66 
 
 
148 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  28.12 
 
 
143 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  25.19 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  28.38 
 
 
151 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  27.82 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  26.15 
 
 
142 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  26.71 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  28.03 
 
 
137 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  26.9 
 
 
450 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  23.81 
 
 
157 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  24.43 
 
 
135 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  24.43 
 
 
135 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>