More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0833 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 		 112 aa  200  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  196  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  196  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  196  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  87.5 
 
 		 112 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 		 112 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 		 112 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 		 112 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 		 112 aa  190  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  81.25 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  75.89 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  75.89 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  74.11 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  75.89 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  71.43 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  73.21 
 
 		 114 aa  167  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  72.32 
 
 		 112 aa  167  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  165  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 114 aa  165  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>